系统依赖项的Packrat:：restore（）

我在Rstudio的Windows机器上开发了一个闪亮的应用程序。现在我需要在Linux机器上开发它，以后需要在服务器上部署它。由于需要跨平台运行应用程序，我正在研究一些环境控制应用程序，这样我就不必手动调整和重新安装所需的软件包

我试着用Packrat来达到这个目的。我在我的Windows机器上制作了一个快照，将该项目复制并粘贴到我的Ubuntu上，在RStudio上重新打开该项目，安装了Packrat，软件包的恢复自动运行。然后我遇到了一个问题，即一些需要系统依赖关系的软件包没有自动安装，例如rgdal和jqr。因此，我不得不在终端中手动安装这些系统依赖项（这花了我一段时间，因为其中大约有10个需要额外的系统依赖项）

我想知道是否有更简单的方法可以自动处理这个问题。稍后，我将需要与系统管理员一起将应用程序部署到服务器。我想知道Packrat是否有能力在Linux机器/服务器上自动安装系统依赖项。如果有人曾经遇到过这个问题，或者有其他更好的选择，请让我知道

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谢谢大家!

大家好，欢迎来到StackOverflow

您面临的问题实际上比您一开始想象的要困难得多——跨不同操作系统部署复杂的R包依赖关系是一个真正困难的问题，说实话，这是一个尚未解决的问题

当然，您可以使用

packrat

和

renv

来获取特定版本的R包依赖项和快照。但这对系统级依赖项没有任何作用，这些依赖项只是被视为“给定的”。所以，不要只是转到另一个盒子里说“abracadabra”。对不起

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我们最接近解决这个问题的可能是Docker，您可以在其中创建一个可移植的执行单元，它可以部署在Docker运行的任何地方：Windows、macOS、不同的Linux风格。。。因为它编码了一切。

谢谢你，德克。我想接下来的方法是使用Docker。是的，这也有点取决于你到底想做什么——例如，Shiny变得如此流行的一个原因是它“去掉了R”：同事/用户/客户只需要一个web浏览器。类似地，通过网络传输的API只需要联网，但随后需要一台服务器。不断地。R包已经是一个相当便携的“单元”，所以这也是一个选择。