加载.Rprofile时，在R上安装程序包失败

当我尝试在R中安装软件包时，如果加载了

.Rprofile

，安装几乎总是失败。然而，当我使用

--vanilla

标志加载R时，我能够毫无问题地安装软件包。这是有问题的R会话的输出。我认为困难要么与

.Rprofile

中的

.First（）

函数有关，要么与历史文件有关

$install.packages（“supplists”）
将软件包安装到“/home/lmullen/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0”中
（由于“lib”未指定）
正在尝试URL'http://cran.cnr.Berkeley.edu/src/contrib/SuppDists_1.1-9.tar.gz'
内容类型“应用程序/x-gzip”长度140784字节（137 Kb）
打开的URL
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下载137 Kb
加载所需包：stats
正在加载所需的包：sp
rgeos版本：0.2-19（SVN修订版394）
GEOS运行时版本：3.3.3-CAPI-1.7.4
多边形检查：TRUE
rgdal:版本：0.8-10（SVN第478版）
已成功加载到R的地理空间数据抽象库扩展
加载的GDAL运行时：GDAL 1.9.0，发布于2011/12/29
GDAL共享文件的路径：/usr/share/GDAL/1.9
已加载的项目4运行时：Rel。4.7.11909年9月23日，[PJ_版本：470]
项目4共享文件的路径：（自动检测）
.External2（C_loadhistory，文件）中出错：没有可用的历史机制
呼叫：。第一次->
停止执行
下载的源程序包位于中
“/tmp/RtmpX42EEZ/download_packages”
警告信息：
在install.packages（“SuppDists”）中：
包“SuppDists”的安装具有非零退出状态

---

有人知道问题是什么吗？

我在

.Rprofile

中找出了导致问题的行，尽管我不知道它们为什么会导致问题。

.First

和

.Last

函数如下：

.First <- function() {
  utils:::loadhistory(file = "~/.Rhistory")
  cat("\nSuccessfully loaded .Rprofile at", date(), "\n\n")
}

.Last <- function() {
  utils:::savehistory(file = "~/.Rhistory")
}

---

。首先亨里克在R-devel邮件列表上给了我答案：

使用

if（interactive（））utils:：loadhistory（file=“~/.Rhistory”）

应该能解决你的问题。原因是中的
install.packages（）
turn启动一个非交互式的child R进程，该进程安装
包裹当该进程加载启动文件时，它会失败，因为
该功能只能在交互模式下使用

在乌本托：
我从R外部安装了它，由于@hugo raguet:

sudo apt-get -y install build-essential
sudo apt-get -y install r-cran-igraph

我相信以后不需要在R中安装igraph。
您是否尝试删除.First函数以查看是否有帮助？我还建议只在交互式会话中加载任何包-通常，我建议不要加载任何包，因为它会导致不可复制的错误code@Dason：我尝试删除.First函数，关于历史记录的错误信息消失了，但软件包仍然没有安装。@hadley:谢谢你的建议。我完全同意装包裹。我总是通过带有--vanilla标志的非交互式会话运行代码。但是我采纳了你的建议，将所有的程序包加载移到了检查会话是否是交互式的函数中。仍然不知道是什么导致了问题？明白了，请看我的回答这里有一个链接
sudo apt-get -y install build-essential
sudo apt-get -y install r-cran-igraph