R 如何使用向量循环数据帧中的一组特定列名称?
我已经为这个问题挣扎了好几天,我对R还是个新手,所以我放弃了,我希望你们中的任何人都能帮助我 我想计算一个特定变量的汇总统计数据,该变量由我想循环的不同变量分组。我不想每次都复制粘贴语法并更改分组变量。我使用了R 如何使用向量循环数据帧中的一组特定列名称?,r,loops,vector,R,Loops,Vector,我已经为这个问题挣扎了好几天,我对R还是个新手,所以我放弃了,我希望你们中的任何人都能帮助我 我想计算一个特定变量的汇总统计数据,该变量由我想循环的不同变量分组。我不想每次都复制粘贴语法并更改分组变量。我使用了for循环和lappy以及vector(存储不同分组变量的地方) 我认为问题在于我的数据帧找不到我存储在向量中的列名 我的代码如下所示: snp_EPA <- c('rs3798713_C', 'rs174550_C', 'rs174574_A', 'rs174448_C') #Ve
for
循环和lappy
以及vector(存储不同分组变量的地方)
我认为问题在于我的数据帧找不到我存储在向量中的列名
我的代码如下所示:
snp_EPA <- c('rs3798713_C', 'rs174550_C', 'rs174574_A', 'rs174448_C') #Vector of grouping variables
for (i in snp_EPA) {
FA %>% group_by(as.name(i)) %>% summarise(FA, bce_c20_5n_3)
} #For loop I tried, didn't work
epa <- lapply(snp_EPA, function(x) {describeBy(FA$bce_c20_5n_3, as.name(x))})
lapply(epa, print) #lapply function I used, still didn't work....
snp_EPA%分组依据(如名称(i))%%>%总结(FA,bce_c20_5n_3)
}#对于循环,我尝试过,但没有成功
epa我们确实需要关于您的数据的更多信息和使用dput(data)
的小样本。我可以告诉你一些方法来得到你想要的东西,这可能会让你开始。我将使用R随附的iris
数据集:
data(iris)
str(iris)
# 'data.frame': 150 obs. of 5 variables:
# $ Sepal.Length: num 5.1 4.9 4.7 4.6 5 5.4 4.6 5 4.4 4.9 ...
# $ Sepal.Width : num 3.5 3 3.2 3.1 3.6 3.9 3.4 3.4 2.9 3.1 ...
# $ Petal.Length: num 1.4 1.4 1.3 1.5 1.4 1.7 1.4 1.5 1.4 1.5 ...
# $ Petal.Width : num 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.4 0.3 0.2 0.2 0.1 ...
# $ Species : Factor w/ 3 levels "setosa","versicolor",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
该数据集包括对三种不同虹膜的4次测量。获取描述性统计数据的一种简单方法是使用split
和summary
:
iris.split <- split(iris, iris$Species)
lapply(iris.split, summary)
# $setosa
# Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
# Min. :4.300 Min. :2.300 Min. :1.000 Min. :0.100 setosa :50
# 1st Qu.:4.800 1st Qu.:3.200 1st Qu.:1.400 1st Qu.:0.200 versicolor: 0
# Median :5.000 Median :3.400 Median :1.500 Median :0.200 virginica : 0
# Mean :5.006 Mean :3.428 Mean :1.462 Mean :0.246
# 3rd Qu.:5.200 3rd Qu.:3.675 3rd Qu.:1.575 3rd Qu.:0.300
# Max. :5.800 Max. :4.400 Max. :1.900 Max. :0.600
# . . . results for other 3 measurements
这些示例使用了所有数字列,但您只能选择带有iris[,1:3]
的一些列来获得前三列,或者iris[,c(1,4)]
来获得第一列和第四列。您希望计算什么类型的汇总?只需要基本的汇总统计信息,如平均值、标准偏差等。
library(RcmdrMisc) # You will have to install it the first time with `install.packages("RcmdrMisc)`.
numSummary(iris[, -5], groups=iris$Species)
#
# Variable: Sepal.Length
# mean sd IQR 0% 25% 50% 75% 100% n
# setosa 5.006 0.3524897 0.400 4.3 4.800 5.0 5.2 5.8 50
# versicolor 5.936 0.5161711 0.700 4.9 5.600 5.9 6.3 7.0 50
# virginica 6.588 0.6358796 0.675 4.9 6.225 6.5 6.9 7.9 50
# . . . results for three other measurements.