从R的原子文件传输

我需要将文件从R内部推送到远程服务器。它需要是原子的（或接近原子的）。从概念上讲，我的想法是首先将其scp到tmp目录，然后将其移动到最终目的地。从R做这件事的好方法是什么？如果相关的话，我使用的是Linux系统。

在R中使用

system

调用。类似于：

system("scp foo.dat remote:/tmp/foo.dat.tmp")
system("ssh remote mv /tmp/foo.dat.tmp /drop/foo.dat")

您可能需要一些额外的参数来

ssh

您可能还希望为临时文件名生成一个随机数

当然，这需要scp/ssh服务器和服务器上的

mv

，这在GNU/Linux的两端都是最简单的

---

在尝试在R中使用

system

调用之前，您可能应该检查

scp

命令的返回状态，看看它是否成功完成。类似于：

system("scp foo.dat remote:/tmp/foo.dat.tmp")
system("ssh remote mv /tmp/foo.dat.tmp /drop/foo.dat")

您可能需要一些额外的参数来

ssh

您可能还希望为临时文件名生成一个随机数

当然，这需要scp/ssh服务器和服务器上的

mv

，这在GNU/Linux的两端都是最简单的

---

在尝试在R中使用

system

调用之前，您可能应该检查

scp

命令的返回状态，看看它是否成功完成。类似于：

system("scp foo.dat remote:/tmp/foo.dat.tmp")
system("ssh remote mv /tmp/foo.dat.tmp /drop/foo.dat")

您可能需要一些额外的参数来

ssh

您可能还希望为临时文件名生成一个随机数

当然，这需要scp/ssh服务器和服务器上的

mv

，这在GNU/Linux的两端都是最简单的

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在尝试在R中使用

system

调用之前，您可能应该检查

scp

命令的返回状态，看看它是否成功完成。类似于：

system("scp foo.dat remote:/tmp/foo.dat.tmp")
system("ssh remote mv /tmp/foo.dat.tmp /drop/foo.dat")

您可能需要一些额外的参数来

ssh

您可能还希望为临时文件名生成一个随机数

当然，这需要scp/ssh服务器和服务器上的

mv

，这在GNU/Linux的两端都是最简单的

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在尝试执行

mv

之前，您可能应该检查

scp

命令的返回状态，看看它是否成功完成。您可以提供一个更具重现性的示例，或者更具体地说明您正在尝试执行的操作吗？例如，你所说的原子是什么意思？二进制数据？我怀疑“原子”在这里意味着文件神奇地出现在一个完整的地方，而不是在传输时逐渐出现。远程服务器不应看到半个文件。对吗？是的@Spacedman这就是我的意思。你能提供一个更具可复制性的例子，或者更具体地说明你正在尝试做什么吗？例如，你所说的原子是什么意思？二进制数据？我怀疑“原子”在这里意味着文件神奇地出现在一个完整的地方，而不是在传输时逐渐出现。远程服务器不应看到半个文件。对吗？是的@Spacedman这就是我的意思。你能提供一个更具可复制性的例子，或者更具体地说明你正在尝试做什么吗？例如，你所说的原子是什么意思？二进制数据？我怀疑“原子”在这里意味着文件神奇地出现在一个完整的地方，而不是在传输时逐渐出现。远程服务器不应看到半个文件。对吗？是的@Spacedman这就是我的意思。你能提供一个更具可复制性的例子，或者更具体地说明你正在尝试做什么吗？例如，你所说的原子是什么意思？二进制数据？我怀疑“原子”在这里意味着文件神奇地出现在一个完整的地方，而不是在传输时逐渐出现。远程服务器不应看到半个文件。对吗？是的，我就是这个意思。谢谢。我尝试了这个方法，它是有效的，除了在第二个命令仍在运行时提交给我的R shell的任何命令（从emacs或从Vim）都被R忽略，这是非常奇怪的行为。关于这一点，我可能会提交第二个stackoverflow问题，这个问题与ssh吃掉发送到R shell的后续命令有关。c、 谢谢。我尝试了这个方法，它是有效的，除了在第二个命令仍在运行时提交给我的R shell的任何命令（从emacs或从Vim）都被R忽略，这是非常奇怪的行为。关于这一点，我可能会提交第二个stackoverflow问题，这个问题与ssh吃掉发送到R shell的后续命令有关。c、 谢谢。我尝试了这个方法，它是有效的，除了在第二个命令仍在运行时提交给我的R shell的任何命令（从emacs或从Vim）都被R忽略，这是非常奇怪的行为。关于这一点，我可能会提交第二个stackoverflow问题，这个问题与ssh吃掉发送到R shell的后续命令有关。c、 谢谢。我尝试了这个方法，它是有效的，除了在第二个命令仍在运行时提交给我的R shell的任何命令（从emacs或从Vim）都被R忽略，这是非常奇怪的行为。关于这一点，我可能会提交第二个stackoverflow问题，这个问题与ssh吃掉发送到R shell的后续命令有关。c、 f。