R 使用do.call时丢失数据帧

我正在尝试使用rbind合并多个数据帧。如果我直接给rbind打电话，没有问题：

> test <- rbind(x)
> is.data.frame(x)
[1] TRUE

根据？rbind文档，我尝试了

添加stringsAsFactors=FALSE

，但行为没有改变。我的数据表如下所示：

ID  sequence    descriptor
1   aaacccttt   g12
2   actttgtgt   e34
3   tttgggctc   b12
4   ccgcgcgcg   c12
…   …       ...

options(stringsAsFactors=FALSE)

rbind输出如下所示，但是

do.call（“rbind”，x）

输出如下所示，其中序列列不再是字符：

ID  363 426 91
Sequence 98 353 100
descriptor  g12 b12 c12 

我想使用do.call，因为我正在循环一组数据帧，以便使用下面的脚本来整合它们。另一个有用的答案可能会提供另一种解决方案，即如何在循环中调用多个数据帧的同时合并多个数据帧

stringsAsFactors = FALSE
dfs <- as.list(ls(pattern="Data_"))
for (i in 1:length(dfs)) {
  x <- get(as.character(dfs[i]))
  AllData <- do.call("rbind", x) 
  }

stringsAsFactors=FALSE
dfs有两个不同的问题会给您带来困难


stringsAsFactors

您查看
stringsAsFactors
是对的，但只是没有在正确的位置调用它

你有两个选择。您可以在
选项中设置它，如下所示：

ID  sequence    descriptor
1   aaacccttt   g12
2   actttgtgt   e34
3   tttgggctc   b12
4   ccgcgcgcg   c12
…   …       ...

options(stringsAsFactors=FALSE)

或者在用于创建数据的代码中。表
s:

a <- read.table(textConnection("ID  sequence    descriptor
1   aaacccttt   g12
2   actttgtgt   e34
3   tttgggctc   b12
4   ccgcgcgcg   c12"),
header=T, stringsAsFactors=FALSE)

即使只有一个
数据.frame
，只要它被包装在一个（长度为1）的
列表中，就像这样：
dfs使用Josh的示例代码一样，这也应该适用于您。我很确定发生的事情是这样的：

Data:
    x <- read.table(textConnection("ID  sequence    descriptor
    1   aaacccttt   g12
    2   actttgtgt   e34
    3   tttgggctc   b12
    4   ccgcgcgcg   c12"),
    header=T, stringsAsFactors=FALSE)

因为只有一个论点，所以什么也不做。也就是说，没有任何附加到数据帧的内容，因此它只返回相同的数据帧。然后：

do.call("rbind", x)

这里发生的事情是使用列表
x
中的所有参数调用
rbind（）
。数据框是以列为元素的列表。因此，这与：

rbind(x$ID,x$sequence,x$descriptor)

所以你把三个向量按行放在一起。因此，这将成为您所拥有的内容的转置，并且由于data.frames只按列存储不同类型的向量，因此必须成为字符矩阵

我认为如果
x
是一个数据帧列表，它就可以正常工作。它本身不应该是一个数据帧。
我认为，使用
Reduce
无需循环就可以实现您的搜索。它是一个高阶函数，它将一个函数连续应用于列表中的两个元素

dfs <- as.list(ls(pattern="Data_"))
Reduce('rbind', dfs)

dfs谢谢Sacha，我想你已经很好地描述了所发生的一切谢谢Ramnath，但是当我尝试这种方法时，我不会返回数据集，而是返回字符矩阵。我不知道Reduce，所以我一定会调查的。
dfs <- as.list(ls(pattern="Data_"))
Reduce('rbind', dfs)