加载包时出现Rsamtools错误

当我想在R中加载Rsamtools包时，我看到错误如下：

  Error in get(method, envir = home) : 
    lazy-load database'/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rsamtools/      R/Rsamtools.rdb' is corrupt
  In addition: Warning messages:
  1: In .registerS3method(fin[i, 1], fin[i, 2], fin[i, 3], fin[i, 4],  :
    restarting interrupted promise evaluation
  2: In get(method, envir = home) :
    restarting interrupted promise evaluation
  3: In get(method, envir = home) : internal error -3 in R_decompress1
  Error: package or namespace load failed for ‘Rsamtools’

sessionInfo的输出为：

  R version 3.2.0 (2015-04-16)
  Platform: x86_64-apple-darwin13.4.0 (64-bit)
  Running under: OS X 10.9 (Mavericks)

  locale:
  [1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

  attached base packages:
  [1] stats4    parallel  stats     graphics  grDevices utils     datasets        methods  
  [9] base     

  other attached packages:
   [1] UniProt.ws_2.8.0     RCurl_1.95-4.6       bitops_1.0-6               RSQLite_1.0.0       
   [5] DBI_0.3.1            BiocInstaller_1.18.2 Biostrings_2.36.1    XVector_0.8.0       
   [9] AnnotationDbi_1.30.1 Biobase_2.28.0       GenomicRanges_1.20.4       GenomeInfoDb_1.4.0  
  [13] IRanges_2.2.3        S4Vectors_0.6.0      BiocGenerics_0.14.0 

  loaded via a namespace (and not attached):
  [1] zlibbioc_1.14.0 tools_3.2.0     biomaRt_2.24.0  XML_3.98-1.2   

不仅我不能使用Rsamtools，而且当我想使用我的旧软件包时，我可以在出现以下错误之前使用它们，例如使用“TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownge”软件包：

  Loading required package: GenomicFeatures
  Error in get(method, envir = home) : 
    lazy-load database       '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/Rsamtools/R/Rsamto      ols.rdb' is corrupt
  In addition: Warning messages:
  1: In .registerS3method(fin[i, 1], fin[i, 2], fin[i, 3], fin[i, 4],  :
    restarting interrupted promise evaluation
  2: In get(method, envir = home) :
    restarting interrupted promise evaluation
  3: In get(method, envir = home) : internal error -3 in R_decompress1                          Error: package ‘GenomicFeatures’ could not be loaded

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我该怎么办？

出人意料！重新启动会话解决了问题：|

是否运行了

update.packages（checkbuild=TRUE）

？此外，还应运行

source（“http://bioconductor.org/biocLite.R"); BioLite（）

。是的，我现在做了，没有任何改变。错误与以前相同使用命令biocLite（）时，它识别“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”是一个旧软件包，但我总是重新选择更新此软件包，因为它大约有600万，并且我的internet连接速度不是很快。您认为错误的原因是“BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19”的旧版本吗？请尝试指定包：

biocLite（“Rsamtools”）

。另外，根据这一页，建议使用

BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19

。我使用了BioLite（“Rsamtools”），但问题尚未解决。相同的问题和相同的解决方案。相同的问题和相同的解决方案！！我只想说，WTF。