如何在R中绘制数据帧的所有列
数据框有n列,我想得到n个图,每列一个图 我是一个新手,我对R不太熟练,不管怎样,我找到了两个解决方案 第一个可以工作,但不打印列名(我需要它们!):如何在R中绘制数据帧的所有列,r,plot,dataframe,R,Plot,Dataframe,数据框有n列,我想得到n个图,每列一个图 我是一个新手,我对R不太熟练,不管怎样,我找到了两个解决方案 第一个可以工作,但不打印列名(我需要它们!): data您可以使用main选项指定标题(以及通过xlab和ylab指定轴的标题)。例如: plot(data[,i], main=names(data)[i]) 如果要绘制(并保存)数据帧的每个变量,应使用png、pdf或所需的任何其他图形驱动程序,然后发出dev.off()命令。例如: data <- read.csv("sample.
data您可以使用main
选项指定标题(以及通过xlab
和ylab
指定轴的标题)。例如:
plot(data[,i], main=names(data)[i])
如果要绘制(并保存)数据帧的每个变量,应使用png
、pdf
或所需的任何其他图形驱动程序,然后发出dev.off()
命令。例如:
data <- read.csv("sample.csv",header=T,sep=",")
for (i in 1:length(data)) {
pdf(paste('fileprefix_', names(data)[i], '.pdf', sep='')
plot(data[,i], ylab=names(data[i]), type="l")
dev.off()
}
data我这台电脑上没有R,但这里有个漏洞。您可以使用par
在一个窗口中显示多个绘图,或类似的方式在显示下一页之前提示单击
plotfun <- function(col)
plot(data[ , col], ylab = names(data[col]), type = "l")
par(ask = TRUE)
sapply(seq(1, length(data), 1), plotfun)
plotfun您可以跳过障碍,将解决方案转换为lappy
、sapply
或apply
调用。(我看到@jonw展示了一种方法)除此之外,您已经拥有的代码是完全可以接受的
如果这些都是一个时间序列或类似的,那么下面可能是一个合适的替代方案,它在一个单独的绘图区域上在自己的面板中绘制每个序列。我们使用zoo
包,因为它可以很好地处理这样的有序数据
require(zoo)
set.seed(1)
## example data
dat <- data.frame(X = cumsum(rnorm(100)), Y = cumsum(rnorm(100)),
Z = cumsum(rnorm(100)))
## convert to multivariate zoo object
datz <- zoo(dat)
## plot it
plot(datz)
require(动物园)
种子(1)
##示例数据
datggplot2package需要一点学习,但是结果看起来非常好,你可以得到很好的图例,还有许多其他很好的特性,所有这些都不需要编写太多代码
require(ggplot2)
require(reshape2)
df <- data.frame(time = 1:10,
a = cumsum(rnorm(10)),
b = cumsum(rnorm(10)),
c = cumsum(rnorm(10)))
df <- melt(df , id.vars = 'time', variable.name = 'series')
# plot on same grid, each series colored differently --
# good if the series have same scale
ggplot(df, aes(time,value)) + geom_line(aes(colour = series))
# or plot on different plots
ggplot(df, aes(time,value)) + geom_line() + facet_grid(series ~ .)
require(ggplot2)
要求(2)
df有一种非常简单的方法,可以使用单独的面板或同一面板绘制数据框中的所有列:
plot.ts(data)
其结果(其中X1-X4为列名):
查看所有选项的?plot.ts
如果您不想更多地控制打印功能,也不想使用循环,也可以执行以下操作:
par(mfcol = c(ncol(data), 1))
Map(function(x,y) plot(x, main =y), data, names(data))
使用晶格
:
library(lattice)
df <- data.frame(time = 1:10,
a = cumsum(rnorm(10)),
b = cumsum(rnorm(10)),
c = cumsum(rnorm(10)))
form <- as.formula(paste(paste(names(df)[- 1], collapse = ' + '),
'time', sep = '~'))
xyplot(form, data = df, type = 'b', outer = TRUE)
库(晶格)
df使用上面的一些技巧(特别感谢@daroczig提供的名称(df)[i]
表单),此函数打印数值变量的直方图和因子变量的条形图。探索数据框架的良好开端:
par(mfrow=c(3,3),mar=c(2,1,1,1)) #my example has 9 columns
dfplot <- function(data.frame)
{
df <- data.frame
ln <- length(names(data.frame))
for(i in 1:ln){
mname <- substitute(df[,i])
if(is.factor(df[,i])){
plot(df[,i],main=names(df)[i])}
else{hist(df[,i],main=names(df)[i])}
}
}
par(mfrow=c(3,3),mar=c(2,1,1,1))#我的示例有9列
dfplot如果.csv
文件中的列名不是有效的R名称:
data <- read.csv("sample.csv",sep=";",head=TRUE)
data2 <- read.csv("sample.csv",sep=";",head=FALSE,nrows=1)
for ( i in seq(1,length( data ),1) ) plot(data[,i],ylab=data2[1,i],type="l")
data我很惊讶没有人提到matplot
。如果您不需要在单独的轴上绘制每条线,这将非常方便。
只需一个命令:
matplot(y = data, type = 'l', lty = 1)
使用?matplot
查看所有选项
要添加图例,可以设置调色板,然后添加图例:
mypalette = rainbow(ncol(data))
matplot(y = data, type = 'l', lty = 1, col = mypalette)
legend(legend = colnames(data), x = "topright", y = "topright", lty = 1, lwd = 2, col = mypalette)
不幸的是,ggplot2没有提供一种不将数据转换为长格式的方法(轻松地)。您可以尝试与之抗争,但这样做只会更容易进行数据转换。以下是所有方法,包括重塑2的melt
、tidyr的gather
和tidyr的pivot\u longer
:
下面是一个简单的示例,使用:
对于相同的问题,此链接帮助了我很多:
p = ggplot() +
geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col1), color = "blue") +
geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col2), color = "red")
print(p)
在第二个示例中,我会像这样初始化循环(我在seq_-along(dat))
,我也不会调用我的数据data
。您的read.csv
可以简化为read.csv(“sample.csv”)
,因为其他参数刚刚被设置为默认值。谢谢,即使它与时间序列有关,我认为它也能帮助我掌握数据。我喜欢一个班轮!只是一个小提示:当添加“plot.type=c(“single”)时,您的系列将绘制在单个绘图上,而不是单独的框:data@GeekOnAcid+1,非常感谢您对“single”的提示。如果您要使用single
,您还应该添加:col=rainbow(ncol(my.data))
或类似的方法来保持行的可读性。回答很好,但为什么你真的需要重塑?谢谢@VerenaHaunschmid,我后来发现:-)因为你只使用数据2中的第一行,所以在read.csv
中设置nrows=1
会更有效。什么是matlab.dark.palete
,它来自哪里?@AlessandroJacopson这是我通常使用的调色板功能。它来自hyperSpec
软件包。但最好在这里使用更多已知的函数,所以我将它改为rainbow
。如果您不知道调色板函数,请查看?rainbow
。很抱歉让您感到困惑。我会在您的答案中添加require(tidyr)
和require(ggplot2)
,这样它将成为一个最小的工作示例。@AlessandroJacopson我想我已经明确说明了这些是必需的。不管怎样,如果代码中穿插了解释,MWE有用吗?对我来说,它是有用的,不管怎样,这是一个品味的问题,谢谢你的回答。
mypalette = rainbow(ncol(data))
matplot(y = data, type = 'l', lty = 1, col = mypalette)
legend(legend = colnames(data), x = "topright", y = "topright", lty = 1, lwd = 2, col = mypalette)
> df <- data.frame(time = 1:5, a = 1:5, b = 3:7)
> df
time a b
1 1 1 3
2 2 2 4
3 3 3 5
4 4 4 6
5 5 5 7
> df_wide <- df %>% pivot_longer(c(a, b), names_to = "colname", values_to = "val")
> df_wide
# A tibble: 10 x 3
time colname val
<int> <chr> <int>
1 1 a 1
2 1 b 3
3 2 a 2
4 2 b 4
5 3 a 3
6 3 b 5
7 4 a 4
8 4 b 6
9 5 a 5
10 5 b 7
ggplot(df_wide, aes(x = time, y = val, color = colname)) + geom_line()
p = ggplot() +
geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col1), color = "blue") +
geom_line(data = df_plot, aes(x = idx, y = col2), color = "red")
print(p)