glmmADMB中的新错误?VARCOR can';t定位rdig
我认为这是一个新引入的bug。至少,它在以前的工作代码中安装了bugglmmADMB中的新错误?VARCOR can';t定位rdig,r,mixed-models,R,Mixed Models,我认为这是一个新引入的bug。至少,它在以前的工作代码中安装了bug library(glmmADMB) epil2$subject <- factor(epil2$subject) fm <- glmmadmb(y~Base*trt+Age+Visit+(Visit|subject), data=epil2, family="nbinom") VarCorr(fm) nlme中的VarCorr仍然可以正常工作: library(nlme) nlme::Va
library(glmmADMB)
epil2$subject <- factor(epil2$subject)
fm <- glmmadmb(y~Base*trt+Age+Visit+(Visit|subject),
data=epil2, family="nbinom")
VarCorr(fm)
nlme
中的VarCorr
仍然可以正常工作:
library(nlme)
nlme::VarCorr(fm) ##WORKS
glmmADMB::VarCorr(fm) ##Still doesn't work.
这是我的系统信息,如果有帮助的话:
> sessionInfo()
R version 3.2.3 (2015-12-10)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] nlme_3.1-125 glmmADMB_0.8.1 MASS_7.3-45
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Matrix_1.2-3 plyr_1.8.3 magrittr_1.5 tools_3.2.3
[5] coda_0.18-1 Rcpp_0.12.3 stringi_1.0-1 grid_3.2.3
[9] stringr_1.0.0 R2admb_0.7.13 lattice_0.20-33
我找到了解决问题的办法。我使用了此处提供的安装代码: . 我不确定是否有必要,但在运行下面的代码之前,我导航到了我的
~R/R-3.2.3/library
文件夹并删除了glmmADMB文件夹
然后我运行下面的代码
install.packages("R2admb")
install.packages("glmmADMB",
repos=c("http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/repos",
getOption("repos")),
type="source")
这将我的glmmADMB更新为版本0.8.3.3,该版本更正了错误(通过将其转化为警告)。它可能与所讨论的nlme中
VarCorr
的更新有关。
install.packages("R2admb")
install.packages("glmmADMB",
repos=c("http://glmmadmb.r-forge.r-project.org/repos",
getOption("repos")),
type="source")