R Geom#u点图显示了不';不显示在我的数据框中

R Geom#u点图显示了不';不显示在我的数据框中,r,ggplot2,R,Ggplot2,我有一个连续几天的y数据点图,以点图的形式呈现,每个组的点数随着时间的推移而变化,在最后一天不知何故创建了一些额外的点 我的第一个想法是检查表格,以验证每天的点数,并且一切都是正确的 ggplot(aes(x=Days,y= value,fill=Animal_type,color=Animal_type))+ geom_dotplot(color="black", binaxis = "y", stackdir = "cent

我有一个连续几天的y数据点图,以点图的形式呈现,每个组的点数随着时间的推移而变化,在最后一天不知何故创建了一些额外的点

我的第一个想法是检查表格,以验证每天的点数,并且一切都是正确的

        ggplot(aes(x=Days,y= value,fill=Animal_type,color=Animal_type))+
geom_dotplot(color="black",
             binaxis = "y",
             stackdir = "center",

             alpha=0.2,aes(group=interaction(Days,Animal_type)))+

scale_y_continuous() +
scale_x_continuous(breaks = as.numeric(axis_x))+
scale_color_manual(values = c("black","#E50914","grey"),
                   aesthetics = c("color","fill"))+

stat_summary(fun.y = "median", fun.args = list(mult = 1),
             geom="line",
             aes(x=Days,y=value,color=Animal_type,group=Animal_type),
             size=1)+

theme_classic()+

theme(aspect.ratio = 1,
      axis.text.x = element_text(size = 10),
      strip.text = element_text(size = 11),
      strip.background = element_blank(),
      strip.placement = "outside")+#function to change the appearance of the axis

labs(y=" ",
     x="Time(Days)",
     color="Animal type",
     fill="Animal type")+

facet_wrap(variable~., scales = "free",strip.position = "left",labeller =as_labeller(c("WBC 10^9/l"="10^9 cells/l","RBC 10^12/l"="10^12 cells/l","Platelets 10^9/l"="10^9 cells/l")))
这是我得到的图表,在第27天,对于“传统”组的动物,有太多的分数,有6分而不是3分 如果查看数据框,这些点不存在(这是前两张图第27天的值):


你能澄清你的问题吗?对于两个单元格/l组,表中每种动物类型有6个值。与绘图中的相同。不,正如您在每个变量中看到的,常规变量只有3个,而SPF变量只有6个。对于10^9组,有6个常规条目。10^12组也一样。如果这些不是你感兴趣的组,你需要更精确。在您发布的数据中,共有12个SPF条目和12个常规条目,分为两组,每组6个条目。非常感谢您的帮助,我没有看到它们(困难的一天)。这不是我的数据,我和人们交谈过,他们实际上运行了两次一些样本,并在样本名称中添加了一个“run2”,我必须使用它来代替第一个。这需要一些时间。
               Sample.ID         variable  value  Animal_type Days    Cell_type
    1       1072       WBC 10^9/l  16.45 Conventional   27       WBC
   2       1073       WBC 10^9/l  25.97 Conventional   27       WBC
   3       1074       WBC 10^9/l  18.20 Conventional   27       WBC
   4       1075       WBC 10^9/l  17.26          SPF   27       WBC
   5       1076       WBC 10^9/l  19.97          SPF   27       WBC
   6       1077       WBC 10^9/l  14.78          SPF   27       WBC
   7       1078       WBC 10^9/l  24.55          SPF   27       WBC
   8       1079       WBC 10^9/l  17.06          SPF   27       WBC
   9       1080       WBC 10^9/l  15.18          SPF   27       WBC
   10      1081       WBC 10^9/l  16.57 Conventional   27       WBC
   11      1082       WBC 10^9/l  15.24 Conventional   27       WBC
   12      1083       WBC 10^9/l  16.80 Conventional   27       WBC
   13      1072      RBC 10^12/l   6.44 Conventional   27       RBC
   14      1073      RBC 10^12/l   2.80 Conventional   27       RBC
   15      1074      RBC 10^12/l   5.91 Conventional   27       RBC
   16      1075      RBC 10^12/l   6.75          SPF   27       RBC
   17      1076      RBC 10^12/l   6.67          SPF   27       RBC
   18      1077      RBC 10^12/l   6.84          SPF   27       RBC
   19      1078      RBC 10^12/l   3.88          SPF   27       RBC
   20      1079      RBC 10^12/l   6.64          SPF   27       RBC
   21      1080      RBC 10^12/l   6.58          SPF   27       RBC
   22      1081      RBC 10^12/l   6.86 Conventional   27       RBC
   23      1082      RBC 10^12/l   3.33 Conventional   27       RBC
   24      1083      RBC 10^12/l   5.99 Conventional   27       RBC