从错误的.Rbuildignore文件生成后，包中缺少Collate字段中的文件

我的包中的一个函数在生成时拒绝添加到包源中，然后在运行R CMD check时失败

我的包位于github上。文件calculate_latitude_and_longitude.R肯定存在于R目录中：

$ ls R  
calculate_latitude_and_longitude.R clean_coordinates_XBLOCK.R  clean_crime_data.R
load_crime_data_by_ward.R clean_coordinates.R
clean_coordinates_YBLOCK.R dccrimedata-package.R

我可以构建这个包，但是由于某些原因，构建没有包含文件calculate_latitude_和_longitude.R。我可以通过浏览tarball中的R目录来验证它是否跳过了这个文件

安装或运行

R CMD check dccrimedata_0.1.tar.gz

后，我在00install.log文件中发现以下错误：

Error in .install_package_code_files(".", instdir) :
files in 'Collate' field missing from '/Users/erikshilts/workspace/dc_crime_data/dccrimedata.Rcheck/00_pkg_src/dccrimedata/R':
  calculate_latitude_and_longitude.R
ERROR: unable to collate and parse R files for package ‘dccrimedata’

我尝试过重命名函数、创建新文件、注释行、删除roxygen标记等，但这些都无助于将函数放入包中

知道怎么回事吗

该函数的完整代码如下所示：

#' Calculate Latitude and Longitude
#'
#' Calculates latitude and longitude from XBLOCK AND YBLOCK coordinates.
#' The coordinates are given in the NAD 83 projection, Maryland state plane,
#' with units in meters. Documentation for this calculation can be found in the
#' README file.
#'
#' @param crime_data data.frame of crime records
#' @return data.frame with two additional columns, latitude and longitude, with units in the standard GPS format
#' @export
calculate_latitude_and_longitude <- function(crime_data) {
  xy_coords <- crime_data[, c('XBLOCK', 'YBLOCK')]

  coordinates(xy_coords) <- c('XBLOCK', 'YBLOCK')

  # NAD83, maryland state plane, units in meters
  proj4string(xy_coords) <- CRS("+init=esri:102285")
  # Transform to latitude and longitude for GPS
  xy_coords <- spTransform(xy_coords, CRS("+init=epsg:4326"))

  xy_coords <- as.data.frame(xy_coords)
  names(xy_coords) <- c('longitude', 'latitude')

  crime_data <- cbind(crime_data, xy_coords)

  crime_data
}

---

您会注意到，我没有在

.git

中转义句点，这导致它忽略任何包含“Xgit”的文件（X是任何字符），从而导致它忽略我的文件“calculate_latitude_and_lon*git*ude.R”

该.Rbuildignore文件错误地转义了

.git

中的句点。下面是.Rbuildignore文件：

.git
.Rhistory
.Rcheck
\.tar\.gz$
out

<> > <>代码> Git < /代码>使它忽略了“经度”一词所命名的文件，因为单词中间的“git”。

.Rbuildignore文件应如下所示：

\.git
\.Rhistory
\.Rcheck
\.tar\.gz$
out

---

正则表达式的乐趣

您的描述文件是什么样子的？您可以在这里看到描述文件：您是否运行了

roxygenize

？git存储库中没有“man”目录。是的，bin/目录中有一个脚本可以运行roxygenize。

.git
.Rhistory
.Rcheck
\.tar\.gz$
out

\.git
\.Rhistory
\.Rcheck
\.tar\.gz$
out