如何使用R从图像中获取像素数据

有人能帮我从R中的图像中获取RGB像素数据吗

我需要这些信息来比较鸟类羽毛的差异，以帮助理解物种形成事件

我的照片是用数码相机拍摄的，现在是NEF文件。无论需要哪种类型的文件，我都可以将文件转换为我想要的任何文件。然而，我更愿意在文件中保存尽可能多的信息（即PNG文件是好的）

为了解决这个问题，我在R中尝试了很多软件包：Pixmap、光栅、ImageMetrics和浏览互联网、测试方法、询问合作学生等。 在Stackoverflow，我试过这个：，但运气不好。我的文件对于R窗口来说也太大（整个数组没有显示），我很难理解生成的数组。对我来说，最好的办法是以矩阵的形式获取数据，或者以另一种更容易理解的方式获取数据。 我发现了很多类似的问题，但是在其他程序（如java、C++、iOS、Matlab、python等）中，我很遗憾不知道如何使用。 我的问题可能是由于我对这类工作的技能低下，但我正在尽我所能地利用我的背景。

---

如果有人能帮助我或给我一些建议，我将非常感激。

首先，我生成一个示例

png

图像：

png("/tmp/test.png")
plot(rnorm(100))
dev.off()

然后我将其转换为可由

pixmap

读取的格式：这里我将png转换为ppm文件，因为我想保留颜色信息。我从命令行使用ImageMagick，但您可以使用任何您想要的程序：

$ convert /tmp/test.png /tmp/test.ppm

接下来，您可以使用

read.pnm

功能从

pixmap

软件包中读取图像：

x <- read.pnm("/tmp/test.ppm")

---

以3x3像素png图像为例：

然后：

---

“不走运”是什么意思？科斯基给了你一个很好的回答。具体点。你试过调整他的解决方案吗？为什么它不起作用呢？使用ImageJ（如果您可以访问OSX，甚至可以使用GraphicConverter），您可能会更开心。同时，假设birdfeathers只覆盖了图像的一部分，提取数组子集以最小化您正在处理的数据的大小。@Andrie，很抱歉没有看到这些，正如您在我的编辑中看到的，我误解了我在做什么。但是，如果您感兴趣，我在尝试测试bill_080答案时收到以下错误消息：picture@size“错误：试图从没有插槽的基本类（“数组”）对象获取插槽“大小”@CarlWitthoft，是的，我刚刚研究过这个问题。ImageJ或Bio7，它们结合了R和ImageJ。谢谢你的建议！：）您应该打开新问题，而不是编辑原始问题并将其添加到其中。如果这解决了您的问题，您可以选中绿色标记，以便向其他用户指示。

dim(x@red)
[1] 480 480

library('png')
download.file('http://i.stack.imgur.com/hakvE.png', 'sample.png')
img <- readPNG('sample.png')
pix.top.left <- img[1,1,]     # row 1, column 1
pix.bottom.left <- img[3,1,]  # row 3, column 1
pix.top.right <- img[1,3,]    # row 1, column 3

> pix.top.left
[1] 1 0 0 1