无分数计算ROC曲线

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我正在使用一个基因优先化程序,我想利用ROC曲线和R的ROCR包来分析它的性能。问题是该程序没有给每个基因打分,它只对基因排序

ROCR仅使用连续数据作为预测。是否可以按降序为每个基因分配一个数字?例如,我对这些基因进行了排序:

  • 基因A
  • 基因B
  • 基因C
我可以分配这些值吗

  • 基因A:3
  • 基因B:2
  • 基因C:1

我不明白你的问题。你能澄清一下你的计划是做什么的吗?它是如何对基因排序的?它为每个基因分配一个分数并对它们进行排序,但不显示分数。由于这个原因,我考虑使用降序的任意分数。ROC分析不依赖于绝对值,所以你只会使用顺序。但是我没有看到二进制分类的方面。你想用分数预测什么?我想对基因排序,那些与疾病相关的基因将是最可能的疾病基因。种子基因表示为1,非种子基因表示为0。vallidation将种子基因视为因果基因,尽管这是一个近似值。