R梦魇：约塞米蒂、R、RStudio和自制

我使用MacBookPro 13英寸视网膜（2013年末）和OS X优胜美地10.10.2。我不希望这对我最大的敌人造成伤害。也许吧

按时间顺序：

从官方网站下载R和RStudio

两个应用都运行了几次，很好

安装了自制软件。在终端中运行了“brew医生”。brew医生说R文件有问题

RStudio开始表现得很怪异

通过CRAN mirror下载了ggplot2 R包。5GB的数据阻塞了“private/var”文件。删除了其中的一些数据

苹果电脑崩溃了，内核恐慌，直到苹果商店的天才删除了苹果电脑并重新安装了OSX

我想继续使用R和RStudio。问题：

我该如何在不再次炸毁Mac的情况下进行这项工作

如何通过自制软件安装R和RStudio

我需要先安装XQuartz吗

如果我安装R和RStudio未拧紧，会发生什么

我应该认识到R、RStudio和自制软件之间存在哪些冲突

安装所有自制、R和RStudio的常见怪癖

我怎样才能在不烧毁房子的情况下让自制、R和RStudio从此过上幸福的生活

谢谢

我该如何在不再次炸毁Mac的情况下进行这项工作

当计算机运行时，不要试图删除交换文件！如果开始删除随机的系统文件，你将度过糟糕的一天

如何通过自制软件安装R和RStudio

您可以使用

brew install R

安装R。您可以使用自制的cask安装二进制RStudio，如

brew install Caskroom/cask/RStudio

我需要先安装XQuartz吗

不，这应该不再必要了

如果我安装R和RStudio未拧紧，会发生什么

没什么不好的；

brew doctor

可能会报告发现，但这些不是错误，您不应该认为它们代表问题，尽管它们对像我这样的维护人员很有帮助，如果您以后尝试诊断构建故障时寻求帮助

我应该认识到R、RStudio和自制软件之间存在哪些冲突

没有重要的冲突。如果您从安装编译器（如果您使用的是brewed R，则这些编译器是不必要的），则以后可能无法从自制中安装gcc（提供gfortran）之类的东西

安装所有自制、R和RStudio的常见怪癖

截至2015年8月，不再需要下面的注释；默认情况下，软件包现在安装到/usr/local/lib/R/x.y/site-library，并且应该能够经受较小的R升级

如果您使用的是brewed R，并且希望安装的软件包能够在R的小升级后继续使用，则可以运行

mkdir-p~/Library/R/3.2/Library

，然后R将默认情况下将软件包安装到该路径（将软件包放在主目录中，而不是放在地下室中）

我怎样才能在不烧毁房子的情况下让自制、R和RStudio从此过上幸福的生活

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请参见上文！

回顾此问题，考虑所有关于在已安装R和Homebrew的Mac上下载R软件包的有用评论和答案：

在RStudio界面的R控制台中，只需键入

install.packages（“软件包名称”）

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因为我已经开始在RStudio中直接下载R软件包，所以我没有遇到任何问题。系统非常满意。

您可能在同一时间安装了两个R。官方“版本和第二个brew版本。Mac fork of R的维护者建议不要使用fink、Macports或homebrew中的任何一种，因为它们的默认程序位置与以二进制形式分发的R的库存版本中假定的位置不同。有些人正在使用brew，但他们比我或你更了解如何在Unix中管理相互依赖关系。为什么要从CRAN获得官方的R for OS X，获得官方的Rstudio，然后再获得自制软件？你最好是用官方的东西或者自制的东西。在后一种情况下，你只能靠自己。如果您在构建R包时需要编译，您可以从Apple和fortran获得所有必需的编译器，因为这些编译器用于生成R。从CRAN获得的所有“东西”以及所需的任何其他工具都可以从OS X 10.6.X到OS X Yosemite使用。我有3个OS X系统。所有10.10.2。都使用最新的RStudio（预览版），R 3.1.2（官方CRAN二进制文件）而且是最新的自制软件。没有任何问题。R完全是一场噩梦，我完全震惊于它甚至可以与Python匹敌……它需要付出巨大的努力才能正常工作，完全是垃圾。谢谢Tim，很好的提示！通过自制软件安装了R和RStudio。@TimSmith，考虑到所有软件包，现在请转到

/usr/local/lib/R/x.y/site library

，当

R

升级到更高的主版本（例如从

x.y

升级到

x.z

）时，它们会发生什么情况？我需要做什么？建议还是最好指定一个通用路径，让brewed

R

安装程序包，而不考虑其版本

x.y

，以便brewed

R

的更高版本可以继续使用这些程序包？因为R有版本化程序包目录的概念，我假设R不承诺使用编译的C代码的程序包在小版本之间是二进制兼容的，所以我相信使用未版本的包目录可能会在R升级后导致崩溃（例如Python）不过，我对这一点并不完全有信心；如果你能找到关于R在升级过程中对软件包兼容性所做承诺的任何文档，我会感兴趣的！我在安装多个软件包（例如tm）时遇到问题…这就是get

------------------------------------ANTICONF错误-----------------配置失败，因为找不到libxml-2.0。请尝试安装：*deb:libxml2 dev（Debian，Ubuntu，