使用Docker在闪亮的app R包中加载包

我有一个闪亮的应用程序，其中使用server.R文件中的

library（）

加载包。这是可行的，但我不确定这是否是最好的方法

当我将此应用程序转换为R软件包时，我删除了

库

调用。添加了一个描述文件和一个R文件，我在其中创建了如下函数：

...
#' @importFrom tidyr gather spread
#' @importFrom viridisLite viridis inferno magma plasma
#' @importFrom writexl write_xlsx
#' @export
#' 
run_my_app <- function(display.mode="normal",launch.browser=TRUE,...) {
  appDir <- system.file("app", package="mypackage")  
  shiny::runApp(appDir,display.mode=display.mode,launch.browser=launch.browser,...)
}

当像docker run--rm-p 127.0.0.1:3838:3838 myimage那样运行时，这会正确启动应用程序，但依赖项包中的函数不起作用，可能是因为我没有任何

library（）

或

require（）

调用

这是第二种方法（就像用户使用闪亮的appr软件包一样），它避免了上述大部分脚本

EXPOSE 3838
RUN Rscript -e 'library(mypackage);mypackage::run_my_app(port=3838,host="127.0.0.1",launch.browser=FALSE)'

但是我已经被docker构建映像卡住了，因为它在构建期间开始运行应用程序，并且应用程序也不能正常工作

当然，我可以跳过R包部分，只使用docker中闪亮的应用程序，但这需要维护另一组代码。我想我更愿意把这个闪亮的应用程序作为一个R包

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如何在停靠闪亮的应用程序R包时使用库的最佳方式？

事实证明，在docker容器中启动闪亮的应用程序有多种方式。它们的工作方式也不同。讨论了细节

我最终选择了第一个方法（出于上面链接中讨论的原因），并保留了

library（）

调用。调用已移动到一个文件

functions.R

（具有其他帮助函数），该文件源于

ui.R

和

server.R

，如

source（“functions.R”，local=TRUE）

。不确定是否需要

local=TRUE

。我在别处看到了它的推荐

关于如何处理NAMESPACE/

library（）

调用以及如何在R包中使用闪亮的应用程序的详细信息，我并不完全清楚。由于

functions.R

中的helper函数用于

ui.R

和

server.R

，因此我在这两个版本中都使用了它们。我不清楚先执行哪个文件

第二种方法不起作用，因为我应该使用

CMD

而不是

RUN

。大概是这样的：

...
#' @importFrom tidyr gather spread
#' @importFrom viridisLite viridis inferno magma plasma
#' @importFrom writexl write_xlsx
#' @export
#' 
run_my_app <- function(display.mode="normal",launch.browser=TRUE,...) {
  appDir <- system.file("app", package="mypackage")  
  shiny::runApp(appDir,display.mode=display.mode,launch.browser=launch.browser,...)
}

---

CMD[“R”、“-e”、“mypackage:：run_my_app（port=3838，host='127.0.0.1'，launch.browser=FALSE）”

您能提供服务器.R和

ui.R

的示例以及您收到的错误消息吗？是（见第11.2节）。