R 当我'；我想用ggplot2绘制重叠密度图？

我想创建重叠密度图。我决定使用ggplot2

我的数据是数据帧格式的。 下面是它们的外观：

Ge<-data.frame(Ge)
dim(Ge)
#[1] 100   1
Ge[1:4,]
#[1]   6.005409  38.681342 102.079283 185.672611
dim(Tr)
#[1] 100   1
Tr[1:4,]
#[1] 12.8678547  1.3034715  1.1372413  0.7973491

但这是我得到的错误：

    Don't know how to automatically pick scale for object of type data.frame. Defaulting to continuous
Error: stat_density requires the following missing aesthetics: x

---

有人能帮我解决这个问题吗？

在可能的情况下，您应该在ggplot中使用单个数据帧。这是语法背后的逻辑，但一开始并不直观。考虑到您的示例代码，

Tr

和

Ge

是因素，您在公共x轴上表示一组值

重塑2软件包有一个方便的工具，用于将单独的数据组合成适合ggplot打印的格式，

melt

。查看软件包文档，但请参阅下面的工作代码和示例输出

require(ggplot2)
require(reshape2)
Ge=runif(n=100)
Tr=runif(n=100)
data=data.frame(Ge,Tr)
names(data)=c('Ge','Tr')
data=melt(data,id.vars=NULL)
ggplot(data,aes(x=value,fill=variable))+geom_density(alpha=.4)

哈德利·威克姆的一本书非常详细地介绍了所有这些信息

更新 我更仔细地复制了OP的代码（偏离了最佳实践），仍然得到了一个功能图，尽管有一个警告

Ge=data.frame(runif(n=100))
Tr=data.frame(runif(n=120))

ggplot()+geom_density(aes(data=Ge,x=Ge[,1]),color='red')+
  geom_density(aes(data=Tr,x=Tr[,1]),color='blue')

不知道如何为类型的对象自动拾取比例 data.frame。默认为连续不知道如何自动 为data.frame类型的对象拾取比例。默认为连续

---

但是Ge和Tr的长度是如何不同的？你能用一个重复的例子来更新你的问题吗

Ge

和

Tr

是什么？您是否仅使用

Tr

然后仅使用

Ge

尝试绘图？这些测试是如何进行的？我更新了我的答案，测试了你的代码，它对我来说是有效的。也许您的数据帧存在一些问题。是否有任何值

NA

或与数值类型不同？尝试

summary（Ge）

和

summary（Tr）

。我检查过，没有NA，但值的格式是：3.848143e-01，…只测试绘图

Tr

，然后只测试

Ge

。让我知道它们是如何工作的。另外，我最初的post是否解决了您的问题？

x

是每个数据帧中列的名称吗？尝试名称

names（Ge）

和

names（Tr）

。在我的示例中，我只是直接引用了我想要的专栏，

Ge[，1]

，这很有效。

Ge=data.frame(runif(n=100))
Tr=data.frame(runif(n=120))

ggplot()+geom_density(aes(data=Ge,x=Ge[,1]),color='red')+
  geom_density(aes(data=Tr,x=Tr[,1]),color='blue')