在导入ggplot2的包中使用ggplotGrob函数时，找不到它

我有一个包裹在这里 它利用了ggplot2，所以我将它导入到我的名称空间文件和描述文件中

名称空间：

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export(HybRIDS)
exportClasses(HybRIDS)
import(Biostrings)
import(ape)
import(ggplot2)
import(grid)
import(gridExtra)
importFrom(png,readPNG)
useDynLib(HybRIDS)

说明：

Package: HybRIDS
Type: Package
Title: Detection and dating of Recombinant Regions in DNA sequence data.
Version: 1.0
Date: 2014-12-18
Author: Ben J. Ward
Maintainer: Ben J. Ward <b.ward@uea.ac.uk>
Description: An R package for the detection and dating of
    Recombinant Regions in DNA sequence data.
License: GPL-2
Depends: methods
Imports: 
    Rcpp (>= 0.11.0),ggplot2,grid,gridExtra,png,ape,Biostrings
LinkingTo: Rcpp
Suggests: knitr,testthat
VignetteBuilder: knitr

我在RStudio中的追踪将我带到包中的以下几行：

arrangeGrob(bars, legendgrob, widths = c(1, 0.13), ncol = 2) at TripletReference.R#244
6 plotBars(plottingSettings) at TripletReference.R#157
5 x$plotTriplet(plotSettings) at TripletReference.R#361
4 FUN(X[[1L]], ...) 
3 lapply(tripletsToPlot, function(x) x$plotTriplet(plotSettings)) at TripletReference.R#361
2 triplets$plotTriplets(Selections, plottingSettings) at HybRIDSObject.R#253
1 test$plotTriplets() 

在三重引用.R#244处使用arrangeGrob的那一行非常简单。它有两个输入，一个是函数中较早时通过以下方式生成的ggplot对象：

bars <- ggplot(plottingFrame, aes(x = X, y = as.factor(Y))) +
                               geom_raster(aes(fill = colour)) + scale_fill_identity() +
                               xlab("Approximate Base Position") +
                               ylab("Sequence Name") +
                               scale_x_continuous(breaks = c(seq(from = 1, to = plottingSettings$MosaicScale, by = plottingSettings$MosaicScale / 10), plottingSettings$MosaicScale), labels = c(frame$bpX[seq(from = 1, to = plottingSettings$MosaicScale, by = plottingSettings$MosaicScale / 10)], max(frame$bpX))) + 
                               scale_y_discrete(labels = c(ContigNames[3], ContigNames[2], ContigNames[1]))

所以我知道已经加载了ggplot2名称空间——我的问题是，为什么我的包会抛出这个错误，即使我已经导入了ggplot2？ggplot2现在唯一依赖的是统计数据和方法

谢谢，

---

Ben W.

尝试在描述文件中的“依赖”而不是“导入”下添加

ggplot2

在使用

grid.arrange

函数时，我遇到了类似的问题，这个解决方案对我很有效

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我的，诚然是初步的，对这个问题的理解是，

gridExtra

在

ggplot2

库尚未加载时调用了

ggplotGrob

函数。

我想我已经找到了答案-这是因为gridExtra没有导入ggplot2，所以gridExtra的arrangeGrob没有找到ggplot2的ggplotGrob吗？一个潜在的问题我看到的问题是

gridExtra

依赖于

grid

，所以当您导入

gridExtra

时，它基于“

grid

的功能将中断。你必须把

gridExtra

放在

dependens

中。这也是我推断出来的——或者至少是类似的，gridExtra使用了ggplot2中的东西，但ggplot2只是一个例子。因此，and搜索它试图通过搜索路径调用的ggplot2函数，即附加的包，而不是通过其导入。

bars <- ggplot(plottingFrame, aes(x = X, y = as.factor(Y))) +
                               geom_raster(aes(fill = colour)) + scale_fill_identity() +
                               xlab("Approximate Base Position") +
                               ylab("Sequence Name") +
                               scale_x_continuous(breaks = c(seq(from = 1, to = plottingSettings$MosaicScale, by = plottingSettings$MosaicScale / 10), plottingSettings$MosaicScale), labels = c(frame$bpX[seq(from = 1, to = plottingSettings$MosaicScale, by = plottingSettings$MosaicScale / 10)], max(frame$bpX))) + 
                               scale_y_discrete(labels = c(ContigNames[3], ContigNames[2], ContigNames[1]))

legendgrob <- rasterGrob(image=legend)

function (x) 
{
    ggplot_gtable(ggplot_build(x))
}
<environment: namespace:ggplot2>