R 查找每个组中的最大值和最小值
我想在下表中找到每个基因的最大值和最小值。 我知道,下面的函数给出了最大值(或最小值),但我无法同时获得这两个值R 查找每个组中的最大值和最小值,r,R,我想在下表中找到每个基因的最大值和最小值。 我知道,下面的函数给出了最大值(或最小值),但我无法同时获得这两个值 tapply(df$Value, df$Gene, max) 谢谢 小型测试集: df <- read.table(header = TRUE, text = 'Gene Value A 12 A 10 A 123 A 1
tapply(df$Value, df$Gene, max)
谢谢
小型测试集:
df <- read.table(header = TRUE, text = 'Gene Value
A 12
A 10
A 123
A 1
B 3
B 5
B 6
C 1
D 3
D 45
D 98
D 234
D 4')
df
返回最大值和最小值的函数
您可以这样做:
tapply(df$Value, df$Gene, range)
# $A
# [1] 1 123
# $B
# [1] 3 6
# $C
# [1] 1 1
# $D
# [1] 3 234
您可以继续使用tapply
,只需修改FUN
参数即可返回多个摘要统计信息。例如:
do.call(rbind, tapply(df$Value, df$Gene, FUN = function(x) c(max = max(x), min = min(x))))
# max min
#A 123 1
#B 6 3
#C 1 1
#D 234 3
尝试库(dplyr);df%>%groupby(Gene)%%>%summary(Min=Min(Value),Max=Max(Value))
range(x)
返回一个两元素向量,其最小值和最大值为x
tapply(df$Value,df$Gene,FUN=function(x)c(Max=Max(x),Min=Min(x))
?聚合(Value~Gene,data=df,FUN=range)
do.call(rbind, tapply(df$Value, df$Gene, FUN = function(x) c(max = max(x), min = min(x))))
# max min
#A 123 1
#B 6 3
#C 1 1
#D 234 3