有人能解释一下R中pvclust函数的输出吗?
在R中的有人能解释一下R中pvclust函数的输出吗?,r,machine-learning,statistics,hierarchical-clustering,pvclust,R,Machine Learning,Statistics,Hierarchical Clustering,Pvclust,在R中的pvclust包中,有pvclust()函数。在函数帮助文件中提供的示例中,有以下函数: boston.pp <- pvpick(boston.pv) 我很难理解输出的含义,尤其是因为我在聚类分析方面的技术背景非常有限。特别是,我不理解每个集群下名称向量的含义。有人能给我解释一下吗?谢谢 描述pvclust: 对于表示为(nxp)矩阵或数据帧的数据,我们假设数据是p个对象的n个观测值,这些对象将被聚类。第i行向量对应于这些对象的第i次观测,第j列向量对应于尺寸为n的第j个对象的
pvclust
包中,有pvclust()
函数。在函数帮助文件中提供的示例中,有以下函数:
boston.pp <- pvpick(boston.pv)
我很难理解输出的含义,尤其是因为我在聚类分析方面的技术背景非常有限。特别是,我不理解每个集群下名称向量的含义。有人能给我解释一下吗?谢谢
描述pvclust:
对于表示为(nxp)矩阵或数据帧的数据,我们假设数据是p个对象的n个观测值,这些对象将被聚类。第i行向量对应于这些对象的第i次观测,第j列向量对应于尺寸为n的第j个对象的样本
pvpick的输出:
集群-字符串向量的列表。每个向量对应于每个簇中对象的名称
是否绘制了pvclust输出的树状图?pvpickclusters
output只列出某个簇中的内部点(pvclust将boston数据集中的每个列视为一个点),如果绘制它,您将在树状图中看到该簇。
默认情况下pvclust集群变量和hclust集群观测值吗?@xyy,是的,您可以试试boston.hc
$clusters
$clusters[[1]]
[1] "rm" "medv"
$clusters[[2]]
[1] "zn" "dis"
$clusters[[3]]
[1] "crim" "indus" "nox" "age" "rad" "tax" "ptratio" "lstat"
$edges
[1] 3 5 9