扩展rstudiodocker映像

我搜索了很长一段时间，尝试了许多建议的解决方案，但没有找到解决我问题的最终方案，我希望我能把这个问题说得足够具体，因为我对整个docker的世界都很陌生

好的，下面是：

• docker容器在离线服务器上运行（基于centOS，我认为这无关紧要）
  • 我们在本地（在Windows机器上，也不重要）提取docker映像，然后在脱机服务器上上载并启动它们

  • 对于rstudio（rocker），这有时会带来不便，因为新软件包无法通过install.packages（'pkgname'）下载，而必须作为tar.gz下载并具有所有依赖项，然后上载和安装；这很有效

  • 然而，有些软件包还需要安装另一个软件，然后我们的变通方法就停止工作了

  • 在特定情况下，我想安装spacyr pcakage，它下载并安装miniconda

  • 它在本地工作，我的工作流程将（编辑）

• docker拉力摇杆/rstudio

• docker容器运行-d-e密码=-p 28787:8787摇臂/rstudio

• docker exec-ti一些名字/bin/bash

• R

• install.packages（'spacyr'）

• library（spacyr）

• spacy\u install（）

• q（）

• 退出

• docker停止使用某些\u名称

• docker提交一些名称rstudio\u spacyr

• --在这里，我将使用服务器上的

  docker save

  和

  docker load

• sudo docker run-d-e PASSWORD=…--rm-p-e ROOT=TRUE 38787:8787

  rstudio_spacyr

现在的问题是：spacyr可以通过

库（spacyr）

加载，但是上次运行的

Spacyu install（）

现在不再显示错误消息：

Finding a python executable with spaCy installed...
Error in set_spacy_python_option(python_executable, virtualenv, condaenv,  : 
  spaCy or language model en is not installed in any of python executables.

但是，如果我进入Rstudio终端并键入

sudo ls/root/miniconda/bin

，我会看到所有东西都在那里。因此，我的提交似乎起了作用，但是我没有root访问权限，因为没有sudo的命令会导致

ls:cannotaccess'/root/miniconda/bin'：权限被拒绝

奇怪的是，如果我用
sudor
从Rstudio终端启动R，那么一切都会正常工作。不幸的是，我们需要它在Rstudio中工作，而不仅仅是在R中

我想做的（我知道其中有些事情很可怕）：


使用chmod更改根文件夹的权限

从Rstudio运行
系统（“sudo-i”）
->会导致tty错误消息

从Rstudio运行
system（'su-'）
->结果是
su:必须从终端运行


现在我真的不知道如何解决这个问题，我将非常感谢能得到的任何帮助

我怀疑我可能必须在docker提交步骤中更改某些内容？或者我真的应该操纵权限和用户吗？也许我还可以看看miniconda是如何安装的，并将其更改为不在root中？但是怎么做呢

非常感谢您的阅读和评论