使用knitr和.Rnw for LaTeX，如何在PDF输出中打印完整的参考书目？

我似乎无法通过黑客破解所有的可能性，在RStudio的PDF输出中插入完整的参考书目，

knitr

、一个.Rnw脚本和“编译PDF”按钮。PDF中所需的文本将是引用作品的详细信息

这是一个小人国bibtex文件，名为

jabrefbibtest.bib

，保存在工作目录中

@Book{GreentargetEngagement2012,
  Title                    = {"2012 - In - House Counsel New Media Engagement Survey"},
  Author                   = {"Inside Counsel "},
  Publisher                = {"Greentarget"},
  Year                     = {"2012"},
  Pages                    = {"20"},
  Plots                    = {"9"},
  Tables                   = {"0"},
  Url                      = {"http://www.greentarget.com/wp-content/uploads/2012/01/2012GTZGICSurveyReportFinal-WebsiteVersion.pdf"}
}
@Book{CitiprivateBank,
  Title                    = {"Intellectual Leadership with Law Watch"},
  Author                   = {""},
  Publisher                = {""},
  Year                     = {"2008"},
  Pages                    = {"2"},
  Plots                    = {"1"},
  Tables                   = {"4"},
  Url                      = {"http://www.citigroup.com/privatebank/lawassociates/pdfs/lawwatch/slipsheet.pdf"}
}

精简后的

.Rnw

脚本

\documentclass[11pt]{article}  

\usepackage[backend=bibtex]{biblatex}
% \addbibresource{}     # not sure if this is needed

\begin{document}

<<bibbackground, echo=FALSE, include=FALSE>>=
setwd("~/R/knitr docs/")
Sys.setenv(TEXINPUTS=getwd(),
           BIBINPUTS=getwd(),
           BSTINPUTS=getwd())
@

\bibliographystyle{plain}
\bibliography{jabrefbibtest}

Here is one citation \cite{GreentargetEngagement2012} and here is a second \cite{CitiprivateBank}.

Now do full References show below?

\printbibliography   
\end{document}

\documentclass[11pt]{article}
\usepackage[backend=bibtex]{biblatex}
%\addbibresource{}#不确定是否需要此选项
\开始{document}
=
setwd（“~/R/knitr docs/”）
Sys.setenv（TEXINPUTS=getwd（），
bibinput=getwd（），
BSTINPUTS=getwd（））
@
\书目样式{plain}
\参考书目{jabrefbibtest}
这里是一个引文{GreentargetEngagement2012}，这里是第二个引文{CitiprivateBank}。
下面有完整的参考资料吗？
\印刷书目
\结束{document}

日志：

! Package biblatex Error: '\bibliographystyle' invalid.

See the biblatex package documentation for explanation.
Type  H <return>  for immediate help.
 ...                                              

l.59 \bibliographystyle{plain}

Use the package option 'style' instead.
I'm ignoring this command.


! LaTeX Error: Can be used only in preamble.

See the LaTeX manual or LaTeX Companion for explanation.
Type  H <return>  for immediate help.
 ...                                              

l.60 \bibliography
                  {jabrefbibtest}
Your command was ignored.
Type  I <command> <return>  to replace it with another command,
or  <return>  to continue without it.

LaTeX Warning: Citation 'GreentargetEngagement2012' on page 1 undefined on inpu
t line 62.
[more omitted]

！包biblatex错误：“\书目样式”无效。
有关说明，请参阅biblatex软件包文档。
键入H以获得即时帮助。
...                                              
l、 59\书目样式{plain}
改为使用包选项“样式”。
我忽略了这个命令。
! LaTeX错误：只能在前言中使用。
有关说明，请参阅LaTeX手册或LaTeX配套手册。
键入H以获得即时帮助。
...                                              
l、 60\参考书目
{jabrefbibtest}
你的命令被忽略了。
键入I以用另一个命令替换它，
或者继续没有它。
LaTeX警告：inpu第1页引用“GreentargetEngagement2012”未定义
第62行。
[更多省略]

除了Latex Companion，谢一辉（Yihui Xie）的动态文档R和knitr，还有两个Latex引物和262页的biblatex I手册，都在这些网站复杂的建议中苦苦挣扎。毫无结果

评论后编辑

PDF文件包含以下内容：

参考资料 这是一条引文，这是第二条引文。

---

下面是否显示了完整的参考信息？

正如错误消息告诉您的那样：

不要使用

\书目样式{plain}

（这不适用于biblatex）；改用

\usepackage[]{biblatex}

中的

样式

选项

\参考书目{jabrefbibtest}

必须放在前言而不是正文中

纠正这些问题后，它应该可以工作：

\documentclass[11pt]{article}  

\usepackage[backend=bibtex]{biblatex}
\bibliography{jabrefbibtest}
% or use \addbibresource{jabrefbibtest.bib}

\begin{document}

Here is one citation \cite{ABFWomenFirstChairs2015} and
here is a second \cite{ACCGCSkills2013}.

Now do full References show below?

\printbibliography   
\end{document}

---

顺便说一句，RStudio可能不支持

biblatex

的默认后端

biber

，因此使用了

backend=bibtex

选项。

我使用下面的设置来获得（注意，我不喜欢在knitr/rmarkdown中更改

wd

，并删除了该选项；而且您在Rnw中的密钥与mwe中的密钥不匹配）:

\documentclass[11pt]{article}
\usepackage[美国]{babel}
\usepackage[style=apa，backend=biber，bibencoding=latin1]{biblatex}
\声明语言应用{american}{american apa}
\addbibresource{jabrefbibtest.bib}
\开始{document}
=
#setwd（“~/R/knitr docs/”）
Sys.setenv（TEXINPUTS=getwd（），
bibinput=getwd（），
BSTINPUTS=getwd（））
@
%\书目样式{plain}
这里是一个引文{GreentargetEngagement2012}，这里是第二个引文{CitiprivateBank}。
下面有完整的参考资料吗？
\印刷书目
\结束{document}

---

在Rnw编织之后，我还必须通过LaTeX编译器运行tex文件，以便第一次呈现引用。

我总是将

\subscription{jabrefbibtest}

放在脚本末尾，我希望引用出现的地方。

要将.bib文件中的所有引用包含在参考书目中，也就是说，即使是你最后没有引用的，也包括这一行

---

\nosite{*}

就在第

\print书目

行之前，如果注释掉/删除

\usepackage[backend=bibtex]{biblatex}

行，会发生什么@本博克：注释掉这一行会产生一个PDF文件——进度！——但是cites是空的[？]，没有完整的参考资料。PS谢谢你的编辑。没有意识到我可以格式化bibtex和视图日志。在Rnw文件中使用

setwd（）

也可能是个坏主意。如果你拿出

围兜背景

块会怎么样？非常感谢你抽出时间。我删除了块，但没有改进，PDF也没有生成。查看日志的部分内容是：“LaTeX警告：输入行3上的空` The书目'环境。}。它找不到.bib文件，尽管它在工作目录中。[这就是为什么我认为需要该块；告诉knitr等在哪里找到bibtex文件]）尝试显式地将.bib放在\书目{jabrefbibtest.bib}你回答了@Yihui，我留下了我的回答，虽然这是一样的，以防它也能提供信息。谢谢你，Yihui。我运行了你的代码，它生成了cites，但不是我最后想要的全部参考书目。这是PDF，这是一个引文GreentargetEngagement2012，这是第二个花旗私人银行现在做的下面显示了完整的参考资料？很抱歉我说得太慢了，但是你的答案的最后一句话是什么意思，以及“通过LaTeX编译器运行tex文件”是什么意思？我打开miktex并通过它运行.tex文件（RStudio/knitr从Rnw文件生成tex）。这添加了参考资料（在此之前，没有参考章节和引文显示为黑体字）。一旦您运行一次tex文件，只要您不更改引用，您就可以在此之后在RStudio中运行rnw文件。如果您更改引用，则需要重新运行tex文件以使引用再次工作。这可能是Yihui对biber和RStudio的引用。

\documentclass[11pt]{article}

\usepackage[american]{babel}
\usepackage[style=apa,backend=biber,bibencoding=latin1]{biblatex}
\DeclareLanguageMapping{american}{american-apa}

\addbibresource{jabrefbibtest.bib}


\begin{document}

<<bibbackground, echo=FALSE, include=FALSE>>=
#setwd("~/R/knitr docs/")
Sys.setenv(TEXINPUTS=getwd(),
           BIBINPUTS=getwd(),
           BSTINPUTS=getwd())
@

%\bibliographystyle{plain}

Here is one citation \cite{GreentargetEngagement2012} and here is a second \cite{CitiprivateBank}.

Now do full References show below?

\printbibliography
\end{document}