素食者中的R cca和predict.cca
我有一个物种表计数数据，它由每个样本行的物种离散计数列组成。样本分为两类：控制和应力，这两类在设计文件中由一列表示：条件。 我的想法是：删除10个样本测试，对数据-10个样本序列进行CCA，并使用CCA预测10个样本的坐标 train.cca事实上，素食主义者只返回预测中一种成分cca或CA的分数。因此，如果希望从多个组件获得结果，必须分别获取组件并将其与cbind组合，就像在CCA组件只有一个轴的情况下：素食者中的R cca和predict.cca,r,prediction,vegan,R,Prediction,Vegan,我有一个物种表计数数据，它由每个样本行的物种离散计数列组成。样本分为两类：控制和应力，这两类在设计文件中由一列表示：条件。 我的想法是：删除10个样本测试，对数据-10个样本序列进行CCA，并使用CCA预测10个样本的坐标 train.cca事实上，素食主义者只返回预测中一种成分cca或CA的分数。因此，如果希望从多个组件获得结果，必须分别获取组件并将其与cbind组合，就像在CCA组件只有一个轴的情况下： ax1 <- predict(object=train.cca, model="C
ax1 <- predict(object=train.cca, model="CCA", type="wa", newdata=test)
ax2 <- predict(object=train.cca, model="CA", rank=1, type="wa", newdata=test)
ax12 <- cbind(ax1,ax2)
points(ax12) # to add points to an existing grapch