计算R中矩阵各列之间的相关性
我在R中有以下矩阵计算R中矩阵各列之间的相关性,r,correlation,R,Correlation,我在R中有以下矩阵mat： x y z rowA -1 1 2 rowB -1 -2 -1 rowC 2 1 -1 如何计算矩阵各列之间的相关性（例如，corr（x，y），corr（y，z），corr（x，z）），而不是将列拆分为向量？我们可以使用combn创建一次取2的列名组合，将矩阵中的组合子集，然后计算它们之间的相关性 combn(colnames(mat), 2, function(x) cor(mat[, x[1]], mat[, x[2]])) #[1]
mat x y z
rowA -1 1 2
rowB -1 -2 -1
rowC 2 1 -1
如何计算矩阵各列之间的相关性（例如，
corr（x，y）corr（y，z）corr（x，z）combncombn(colnames(mat), 2, function(x) cor(mat[, x[1]], mat[, x[2]]))
#[1] 0.5 -0.5 0.5
mat <- structure(c(-1L, -1L, 2L, 1L, -2L, 1L, 2L, -1L, -1L), .Dim = c(3L,
3L), .Dimnames = list(c("rowA", "rowB", "rowC"), c("x", "y", "z")))
mat您可以执行以下操作：
#gives pairwise
COR = cor(M)
# to get 1 vs 2, 1 vs 3 and 2 vs 3
COR[upper.tri(COR)]
基准R：
cor_df <- data.frame(vars = row.names(cor(mat)), cor(mat), row.names = NULL)
cor_dfcor（mat）
应该可以正常工作。