如何避免污染当前作用域(使用“library(…)”)
作为一项长期政策,我避免将名称导入(也称为“污染”)当前范围,而是在引用不同包中定义的项目时使用完全限定名称 下面的脚本显示,在R中,使用限定名本身是不够的如何避免污染当前作用域(使用“library(…)”),r,import,fully-qualified-naming,R,Import,Fully Qualified Naming,作为一项长期政策,我避免将名称导入(也称为“污染”)当前范围,而是在引用不同包中定义的项目时使用完全限定名称 下面的脚本显示,在R中,使用限定名本身是不够的 #!/usr/bin/env Rscript set.seed(0) x <- local({ x0 <- matrix(rnbinom(80, size = 5, mu = 10), nrow = 20) `rownames<-`(rbind(0, c(0, 0, 2, 2), x
#!/usr/bin/env Rscript
set.seed(0)
x <- local({
x0 <- matrix(rnbinom(80, size = 5, mu = 10), nrow = 20)
`rownames<-`(rbind(0, c(0, 0, 2, 2), x0),
paste("Tag", 1:(nrow(x0) + 2), sep = "."))
})
y <- edgeR::DGEList(counts = x,
group = rep(1:2, each = 2),
lib.size = 1001:1004)
## library(edgeR)
y[1, 1]
脚本的唯一罪过似乎是没有在失败语句之前的某个地方包含行library(edgeR)
,因为如果对注释掉的行取消注释,错误就会消失
这是伏都教,伊莫
有没有一种方法可以避免错误而不污染当前作用域的
库(edgeR)
?当您避免加载edgeR
包时,您也可以避免加载[.DGEList
方法,这是执行y[1,1]所必需的
。如果您不想加载edgeR
库,则需要直接调用提取函数:
edgeR::`[.DGEList`(y, 1, 1)
如果您不喜欢完全限定语法,可以引入所需的方法
`[.DGEList` <- edgeR::`[.DGEList`
`[.DGEList`当您避免加载edgeR
包时,也避免加载[.DGEList
方法,这是执行y[1,1]
所必需的。如果您不想加载edgeR
库,则需要直接调用提取函数:
edgeR::`[.DGEList`(y, 1, 1)
如果您不喜欢完全限定语法,可以引入所需的方法
`[.DGEList` <- edgeR::`[.DGEList`
`[.DGEList`看看模块包。@G.Grothendieck:谢谢你的建议,但我承认,在快速浏览了模块
网站之后,我不清楚这个包在这种情况下会有什么帮助。你介意详细说明一下吗?看看模块包。@G.Grothendieck:谢谢你的建议,但是我承认,在快速浏览了<代码>模块<代码>网站后,我不清楚这个包会如何帮助你。你介意详细解释一下吗?谢谢!BTW,我不考虑<代码> [Digelist'谢谢!BTW,我不考虑<代码> [dgelist]