更改R包中的函数并在Ubuntu上安装_R_Postgresql_Ubuntu_Devtools

更改R包中的函数并在Ubuntu上安装

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更改R包中的函数并在Ubuntu上安装,r,postgresql,ubuntu,devtools,R,Postgresql,Ubuntu,Devtools,简短问题：我想编辑RPostgreSQL包中的postgresqlWriteTable函数，并将其安装到运行在Ubuntu机器上的R上详细解释：我的问题的根源是，我试图使用dbWriteTablefromRPostgreSQLpackage从R向具有自动递增主键列的postgres表写入数据我读了这篇文章：它建议通过更改RPostgreSQL包中的函数postgresqlWriteTable来解决我的问题。当我在OSX环境中以交互方式使用fixInNamespace并编辑函数时，它会起作用

简短问题：我想编辑

RPostgreSQL

包中的

postgresqlWriteTable

函数，并将其安装到运行在Ubuntu机器上的R上

详细解释：

我的问题的根源是，我试图使用

dbWriteTable

from

RPostgreSQL

package从R向具有自动递增主键列的postgres表写入数据

我读了这篇文章：它建议通过更改

RPostgreSQL

包中的函数

postgresqlWriteTable

来解决我的问题。当我在OSX环境中以交互方式使用

fixInNamespace

并编辑函数时，它会起作用

不幸的是，我必须在Ubuntu上运行R的AWS实例上运行我的脚本。我已将

RPostgreSQL

安装在我的计算机上的以下位置：

/usr/local/lib/R/site library/RPostgreSQL

。我通过调用

R CMD install RPostgreSQL_0.4-1.tar.gz安装了它

现在我正在尝试查找函数

postgresqlWriteTable

。它应该在文件

PostgreSQLSupport.R

中。我搜索了整个图书馆——没有这样的档案

我意识到在OSX Finder的本地机器上，当我解压缩tar.gz包文件夹时，我可以看到文件

PostgreSQLSupport.R

，我应该在那里更改函数

所以我改变了函数。然后，我从我的Ubuntu机器上删除了已安装的RPostgreSQL，并将新文件夹（从我的本地机器上）复制到我的Ubuntu机器上，并尝试使用

devtools

安装程序包，如本文所示：

发生的事情如下：

> library("devtools")
> install("/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL")
Error: Can't find '/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL'.
> install("RPostgreSQL", "/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL")
Installing RPostgreSQL
'/usr/lib/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore --quiet  \
  CMD INSTALL '/datasci/nikhil/RPostgreSQL'  \
  --library='/usr/local/lib/R/site-library' --install-tests 

* installing *source* package ‘RPostgreSQL’ ...
file ‘R/PostgreSQLSupport.R’ has the wrong MD5 checksum
ERROR: 'configure' exists but is not executable -- see the 'R Installation and Administration Manual'
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/RPostgreSQL’
Error: Command failed (1)

我已经智穷了

将pacakge

.tar.gz

文件复制到AWS机器上

解压此文件，以获得目录结构

编辑文件中的函数并保存更改

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devtools:：build

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.tar.gz

文件

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