R 强制ggplot2包含一个带0点的簇/组，以保持两个图之间的组号一致

ggplot2不包括没有编号的组/群集

使用ggplot2生成两个单细胞RNA序列数据的UMAP图。它们都有19个簇（行），但其中一个簇有一个带零的raw（raw#2）。现在，ggplot2跳过raw，0导致一个簇中有18个簇，另一个簇中有19个簇，并且分配给每个簇的颜色在两个图之间不匹配

我使用以下ggplot2脚本来绘制UMAP数据

ggplot(pa.dt[type=="FT"], aes(UMAP_1, UMAP_2))+geom_point(size=2, shape=21, aes(fill=immgen.main))+scale_color_manual(values =color_clusters, aesthetics = "fill")

以下是19个簇的绘图示例

这是一个有18个集群的集群

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显然，跳过一个簇（0）会打乱颜色分配的顺序。如果有任何指针指示ggplot2不要跳过包含0的行，我将不胜感激

我认为在将数据输入任一绘图之前，您需要将用于填充美学的变量，

immgen.main

，转换为因子。我尝试了这个方法，但没有成功。ggplot2仍然使用0跳过该行。这很痛苦，但我只需要手动获取对应于0行的数字。我认为您需要将用于填充美学的变量，

immgen.main

，转换为一个因子，然后再将数据输入到任一绘图。我尝试了这一点，但没有成功。ggplot2仍然使用0跳过该行。这很痛苦，但我只需要手动获取0行对应的数字。