问题：R Studio中的工作目录；"；在包含打开的R标记文件的目录上

我使用的是R的最新版本（3.3.2），运行在MacOS Sierra（10.12.3）上的最新版本RStudio（1.0.136）。我遇到了一个问题，我的工作目录与包含我当前在RStudio中打开的.RMD文件的目录相对应，并且被卡住了。打开文件后，工作目录被正确设置为保存.Rproj文件的目录。但是，当我加载一个路径与该目录相关的文件时，我会得到一个错误，即当前工作目录中没有这样的文件，并且该错误会将.RMD文件的位置返回为该工作目录

但是，工作目录（使用

getwd（）

）仍然读取工作目录应该位于的位置，并且无论我尝试将其设置在何处，当我尝试读取文件时仍然会收到相同的错误消息。值得注意的是，我没有收到工作目录无法更改的错误消息——R告诉我工作目录已更改，并且该目录据称是当前工作目录……但事实并非如此

据我所知，我已经完全尝试过卸载R和R studio并重新安装，但没有成功。有人有解决办法吗？这让我现在非常沮丧，因为我必须修改笔记本中的所有相关路径，我已经定义了这些路径，以便在此期间完成我的工作

额外信息，以防相关：我从一个时间机器备份中恢复，我怀疑可能已被破坏；我的应用程序文件夹中的某些内容丢失，我必须手动移动这些内容。这可能是问题的根源吗？在与文件系统交互时，R是否依赖于其他系统文件？我试图避免进行干净的操作系统安装或零碎地重建文件，因为我不知道这是否真的是问题所在

---

---

提前谢谢

这是一个已知的RStudio笔记本（工作目录大约在一半以下）。笔记本与文件在同一目录中执行。正如@Simon Jackson所指出的，您可以使用

knitr:：opts\u knit$set（root.dir=normalizePath（））

更改此设置

这是一个已知的RStudio笔记本（工作目录大约在一半以下）。笔记本与文件在同一目录中执行。正如@Simon Jackson所指出的，您可以使用

knitr:：opts\u knit$set（root.dir=normalizePath（））

更改此设置

当不使用RStudio时，您可以更改工作目录吗？您在尝试编织.Rmd文件时是否遇到问题？如果是这样，所有代码块都将根目录视为.Rmd的目录，而不是项目的目录。例如，如果它是项目目录下的一个目录，您可以添加

knitr:：opts_knit$set（root.dir='../'）

，使路径文件相对于项目目录。@Gregor-Yup！不使用RStudio并将.RMD文件中的相同代码直接写入R控制台时没有问题。@SimonJackson问题发生在我尝试在.RMD中内联运行代码时——自从问题出现tbqh以来，我没有尝试过编织任何东西。您是编织.RMD文件还是将其作为笔记本运行？您可以更改工作模式吗不使用RStudio时的目录？尝试编织.Rmd文件时是否遇到问题？如果是这样，所有代码块都将根目录视为.Rmd的目录，而不是项目的目录。例如，如果它是项目目录下的一个目录，您可以添加

knitr:：opts_knit$set（root.dir='../'）

，使路径文件相对于项目目录。@Gregor-Yup！不使用RStudio并将.RMD文件中的相同代码直接写入R控制台时没有问题。@SimonJackson问题发生在我尝试在.RMD中内联运行代码时——自从问题出现tbqh以来，我从未尝试过编织任何东西。您是编织.RMD文件还是将其作为笔记本运行？谢谢您提供的信息！这对我来说似乎很奇怪，因为我在一个研讨会上与许多使用相同文件的人一起工作，他们的RStudio行为与我使用相同版本的RStudio行为不同。。。我将使用该代码作为解决方法，所以谢谢！这是偶然的新行为吗？我不这么认为。我很确定我记得在预览版中看到过它。很有趣。我刚刚与同事确认，我们使用的是同一版本。讲师分发我们都在本地运行的.Rmd笔记本，它们的代码块引用它们设置的任何工作目录，而不运行任何knitr包函数，至少是有意的。我很困惑。我从我的导师那里了解到，我们实际上并没有使用笔记本，而是使用普通的R标记文件。这是我的想法，但我自己也在猜测。那么，我想回到原点。谢谢你的信息！这对我来说似乎很奇怪，因为我在一个研讨会上与许多使用相同文件的人一起工作，他们的RStudio行为与我使用相同版本的RStudio行为不同。。。我将使用该代码作为解决方法，所以谢谢！这是偶然的新行为吗？我不这么认为。我很确定我记得在预览版中看到过它。很有趣。我刚刚与同事确认，我们使用的是同一版本。讲师分发我们都在本地运行的.Rmd笔记本，它们的代码块引用它们设置的任何工作目录，而不运行任何knitr包函数，至少是有意的。我很困惑。我从我的导师那里了解到，我们实际上并没有使用笔记本，而是使用普通的R标记文件。这是我的想法，但我自己也在猜测。那么，回到原点吧，我想。