R 打印嵌套对象

我是R新手，正在尝试找出如何打印/保存嵌套在列表中的class S4对象

这是列表的结构。该列表包含许多类似于图中所示的mm9 fasta序列子集。它们包含不同数量的行，列出了多个fasta文件中输入序列之间的匹配：

如果我尝试使用

write.table

像：

write.table(tgt_cacgtg, file="tgt_cacgtg.csv", sep=",")

我得到：

（函数（…，row.names=NULL，check.rows=FALSE，check.names=TRUE）中出错，参数表示行数不同：1、6、5、2、7、4、11、3、17、8、9

如果我尝试使用

sink

我会得到一个txt文件，其中列出了每个mm9 fasta序列最多11行，否则会给出如下内容：

$`mm9_chr7_149721485_149878684_+_tgt17'
Views on a 157199-letter BString subject
   subject: ggaccagctcagcaggggcagggggcaggagcagatccctggag...gagtctgtgttctcactccggcctaaaacttttgccacactctc

   views:
          start    end width
     [1]   3291   3296     6 [cacgtg]
     [2]  11561  11566     6 [cacgtg]
     [3]  16247  16252     6 [cacgtg]
     [4]  24249  24254     6 [cacgtg]
     [5]  26048  26053     6 [cacgtg]
     ...    ...    ...   ... ...
   [13]  86453  86458     6 [cacgtg]
   [14] 119849 119854     6 [cacgtg]
   [15] 129404 129409     6 [cacgtg]
   [16] 145612 145617     6 [cacgtg]
   [17] 150437 150442     6 [cacgtg]

---

关于如何将类S4保存到文件中的任何建议？

write table

仅用于将矩形对象（如data.frames）写入文件。您可能认为对象是矩形的，但其类结构中存储的额外元数据不能以这种方式保存

有一个功能

save

，可以保存（几乎）任何类型的R对象：

save(tgt_cacgtg,file="tgt_cacgtg.RData")

然后可以加载

load("tgt_cacgtg.RData")

（重要提示：不要指定载荷的值

load("tgt_cacgtg.RData") -> tgt_cacgtg

---

将不会执行您想要的操作。对象将自动加载为其旧名称）

欢迎来到StackOverflow！我对您的问题做了一些相对较小的编辑，希望能让大家更清楚、更容易回答。主要的是，我在您的列表结构截图中添加了一行，这样大家就不必去imgur查看了。如果您能编辑包含该inf的问题，那就更好了代码块中的格式在这里是文本而不是图像。我的缺点是我没有更清楚地解释我需要一个.csv（甚至.txt）列出每个范围和带有fasta序列标识符的文本行的文件。我不熟悉您正在使用的特定类，但在对象或其组成部分上调用

as.data.frame

是否会产生任何可用的内容？如果没有，请查看描述该类的帮助页面。您可能能够获得您想要的内容通过使用

@

操作符提取对象的一个或多个特定插槽来进行。