将图形直接放入Knitr文档（不将其文件保存在文件夹中）

我正在RStudio中创建一个名为test.Rnw的文档，其MWE如下所示：

\documentclass[12pt,english,nohyper]{tufte-handout}
\usepackage{tabularx}
\usepackage{longtable}

\begin{document}

<<setup, echo = FALSE>>=
library(knitr)
library(xtable)
library(ggplot2)
@

<<diamondData, echo=FALSE, fig.env = "marginfigure", out.width = "0.95\\linewidth", fig.cap = "The diamond dataset has varibles depth and price.", fig.lp = "mar:">>=
print(qplot(depth,price,data=diamonds))
@

<<echo=FALSE,results='asis'>>=
myDF <- data.frame(a = rnorm(1:10), b = letters[1:10])
print(xtable(myDF, caption= 'This data frame shows ten random variables from the normal distribution and a corresponding letter', label='tab:dataFrame'), floating = FALSE, tabular.environment = "longtable", include.rownames=FALSE)
@

Figure \ref{mar:diamondData} shows the diamonds data set, with the variables price and depth. Table \ref{tab:dataFrame} shows letters a through j corresponding to a random variable from a normal distribution.

\end{document}

\documentclass[12pt，英语，nohyper]{tufte讲义}
\usepackage{tablarx}
\usepackage{longtable}
\开始{document}
=
图书馆（knitr）
图书馆（xtable）
图书馆（GG2）
@
=
打印（qplot（深度、价格、数据=钻石））
@
=
myDF更改标题文本的颜色可以在LaTeX中完成，方法是将
\setcaptionfont
环境中的
\color
设置为黑色（代码第8行）

以你的例子：

\documentclass[nohyper]{tufte-handout}
\usepackage{tabularx} 
\usepackage{longtable}

\setcaptionfont{% changes caption font characteristics
  \normalfont\footnotesize
  \color{black}% <-- set color here
}

\begin{document}

<<setup, echo=FALSE>>=
library(knitr)
library(xtable)
library(ggplot2)
# Specify directory for figure output in a temporary directory
temppath <- tempdir()
opts_chunk$set(fig.path = temppath)
@

<<diamondData, echo=FALSE, fig.env = "marginfigure", out.width="0.95\\linewidth",
fig.cap = "The diamond dataset has varibles depth and price.",fig.lp="mar:">>=
print(qplot(depth,price,data=diamonds))
@



<<echo=FALSE,results='asis'>>=
myDF <- data.frame(a = rnorm(1:10), b = letters[1:10])
print(xtable(myDF, caption= 'This data frame shows ten random variables from the
distribution and a corresponding letter', label='tab:dataFrame'),
 floating = FALSE, tabular.environment = "longtable", include.rownames=FALSE)
@

Figure \ref{mar:diamondData} shows the diamonds data set, with the
variables price and depth.Table \ref{tab:dataFrame} shows letters a through j
corresponding to a random variable from a normal distribution.

\end{document}

\documentclass[nohyper]{tufte讲义}
\usepackage{tablarx}
\usepackage{longtable}
\setcaptionfont{%更改标题字体特征
\正常字体\脚注大小
\颜色{黑色}%你为什么不创建一个R标记文件，直接编织成pdf？你使用的是哪种平台：mac、pc、linux等？@GwenaëlGouérou：谢谢你的评论。我对这些差异非常不熟悉，也没有意识到如果我将脚本从.Rnw转换成.Rmd，图像可以直接编织成pdf文件。我已经阅读了at.Rmd不如.Rnw灵活，并且会担心其他一些功能可能会丢失？我正在接管其他人的项目，而那个人是在.Rnw中创建脚本的，所以我想知道这是否是有原因的（好像无法使用.Rmd完成）。我还想知道从.Rnw转换为.Rmd来测试它有多困难？@JimM。谢谢。我正在使用Mac。不过，我正在将其包装到一个R包中（该包生成带有摘要统计信息的输出.pdf文件）。因此，它可以被不同平台的人使用。无论你如何删除文件，这都必须在PDF文件编译后发生。这就是为什么Jim M.的答案不起作用。你是否考虑过在临时目录中编译，然后复制PDF？你也可以试试。谢谢你的输入，但我担心这可能是一个错误n不安全的解决方案：（.我不小心将“fig_目录”设置到我的桌面路径，它删除了我桌面上的所有内容（它们也不在“垃圾桶”中，它们似乎完全消失了？）。我正试图将其放入一个R软件包中，因此我不认为我能够拥有rm-R功能，因为从用户的计算机上删除文件几乎就像恶意软件一样。这对我来说似乎也是一个很好的解决方案，但不幸的是，我可能必须找到另一个解决方案…我想知道为什么这个答案会受到赞誉-espe特别是如果这意味着我做错了什么？因为即使我在删除桌面上的所有内容后尝试运行此操作（这样它不会删除我想要保留的文件，并且只删除figure文件夹中的文件），我仍然会遇到一个错误“/Desktop/figure/diamondData-1.png”找不到。”我认为它删除图形太快了。如果没有这些图形文件，当我在.tex文件上运行pdflatex时，.pdf文件中没有图形，因为它们在编织后立即被删除。或者我做错了什么吗？再次感谢。这不会起作用，因为在编译pdf之前，图形目录已被清除。您应该可以ll
system（）
在
Rnw
文件之外，该文件存在将
fig_目录
传递到
knitr
的问题。此外，我认为
fig.path
的全局块选项将是合适的。@Josephudson:好的观点。我已经根据您和user2706569的建议对代码进行了更改。你们好欧，谢谢你的帮助。看起来这是一个比以前更好的解决方案。所以，它基本上创建了一个临时文件夹，并将数字存储在其中？这个临时文件夹多长时间被删除一次？