在'R'中使用'boot'函数的'parallel'选项`

我在

R

中使用

boot

函数来实现引导。我的问题是如何设置

boot

以利用其并行选项。考虑以下具体的估计中位数的例子：

med_est <- function(dat, indices){
    .dat <- dat[indices]
    median(.dat)
}
dat <- rnorm(200)
system.time(boot(dat, med_est, R = 10000))
system.time(boot(dat, med_est, R = 10000, parallel = "multicore"))

---

med_est来自
boot
手册（粗体是我的）

引导（数据、统计、R、sim=“普通”，stype=c（“i”、“f”、“w”），
地层=rep（1，n），L=NULL，m=0，权重=NULL，
ran.gen=function（d，p）d，mle=NULL，simple=FALSE。。。，
并行=c（“否”、“多核”、“雪”），
ncpus=getOption（“boot.ncpus”，1L），cl=NULL）

尝试：

此外，您可能需要执行类似于
library（doMC）的操作；registerDoMC（detectCores（））
，或任何您喜欢的并行软件包。@Chris
引导
手册说它加载
并行
命名空间，该命名空间已经是
snow
和
doMC
的组合，因此无需加载库
boot
确实提供了指定集群的选项，但是手册中说，如果用户没有指定集群，它将创建集群。我认为OP的问题在于默认的
ncpus
是1L，而不是
detectCores（）
。
system.time(boot(dat, med_est, R = 10000, parallel = "multicore", ncpus=2))