用图解法绘制IGRAPHE网络

我想创建这个简单的igraph绘图：

library(igraph)
mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=T)
plot(mygraph, vertex.label.dist=2)

和其他组合或命令图，但我找不到正确的方法

我怎么做

我提出了一个新问题，直接使用DiagrammeR获得相同的结果，而不使用igraph：

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似乎有两件事正在发生

library(igraph)
library(DiagrammeR)

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=TRUE)

没有警告和渲染

mygraph2 <- from_igraph(mygraph)
render_graph(mygraph2)

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似乎有两件事正在发生

library(igraph)
library(DiagrammeR)

mydata <- data.table(from=c("John", "John", "Jim"),to=c("John", "Jim", "Jack"))
mygraph <- graph_from_data_frame(d=mydata, directed=TRUE)

没有警告和渲染

mygraph2 <- from_igraph(mygraph)
render_graph(mygraph2)

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在你的过程中有两个问题

第一个是来自_igraph的命令。我不确定，可能是软件包中的一个bug，可能是我的设置有问题，但我无法使用它来获得想要的结果。下面的代码在我的机器上运行

mygraph3 <- from_adj_matrix(as.matrix(get.adjacency(mygraph)), mode = "directed")

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在你的过程中有两个问题

第一个是来自_igraph的命令。我不确定，可能是软件包中的一个bug，可能是我的设置有问题，但我无法使用它来获得想要的结果。下面的代码在我的机器上运行

mygraph3 <- from_adj_matrix(as.matrix(get.adjacency(mygraph)), mode = "directed")

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您想要渲染图吗？您想要渲染图吗？这样做更好吗？还是尝试直接使用Diagrammer创建图，而不使用igraph？我需要从大型数据集创建图。我第一次尝试使用igraph，因为它会自动将节点放置在一个好的位置。这是我在教程中读到的。但我不知道这两种方法都有什么好处或坏处。虽然我使用的软件包越少越好，但也许我不需要IGRAPHE步骤。如果你的图形很大，那么自动生成图形而不是键入graphviz代码会很有用，我不知道generate_dot，所以我可以自己使用它来生成初始graphviz代码，然后，我可以手动更改，直接从mydata生成图形的命令是什么？一个data.frame，其中包含列from和to？这样做更好吗？还是尝试直接使用Diagrammer创建图形，而不使用igraph？我需要从大型数据集创建图形。我第一次尝试使用igraph，因为它会自动将节点放置在一个好的位置。这是我在教程中读到的。但我不知道这两种方法都有什么好处或坏处。虽然我使用的软件包越少越好，但也许我不需要IGRAPHE步骤。如果你的图形很大，那么自动生成图形而不是键入graphviz代码会很有用，我不知道generate_dot，所以我可以自己使用它来生成初始graphviz代码，然后我可以手动更改，直接从mydata a data.frame生成图形的命令是什么？如果我们将您的方法的结果与user20650的方法进行比较，您的方法不会生成箭头。设置模式=直接从_adj_matrix@skan我在帖子中纠正了那个错误。要从相邻矩阵生成有向图，参数模式必须设置为有向，然后它将为您提供有向图。感谢您指出这一点。直接从mydata生成图形的命令是什么？data.frame中包含列from和to？在节点中添加标签也很好。如果我们将您的方法的结果与user20650的方法进行比较，您的不产生箭头。设置模式=从_adj定向_matrix@skan我在帖子中纠正了那个错误。要从相邻矩阵生成有向图，参数模式必须设置为有向，然后它将为您提供有向图。感谢您指出这一点。直接从mydata生成图形的命令是什么？一个data.frame，其中包含列from和to？在节点内添加标签也很好。

grViz(generate_dot(mygraph2))

mygraph3 <- from_adj_matrix(as.matrix(get.adjacency(mygraph)), mode = "directed")

render_graph(mygraph3)