将数据帧与日期范围合并,以宽格式允许连续日期跟随开始日期直到结束日期,以R

将数据帧与日期范围合并,以宽格式允许连续日期跟随开始日期直到结束日期,以R,r,dataframe,merge,pivot,R,Dataframe,Merge,Pivot,我对R比较陌生,刚过一年,对一些基本的东西有点执着 我有一个数据框架,其中包括一些植物病害数据、开花日期(日期)和进行评估的城镇(df1)。此外,还有一些特定地区和感兴趣年份的天气数据。我想将df1中的开花日期与df2中的相应日期合并,直到df1中添加的结束日期,但要以宽幅格式进行合并,以便进行相关性分析 事实上,我有15个地方有自己独特的开花日期和4个疾病变量 下面我放置了一个数据样本,从中我了解了如何合并两个df library(dplyr) library(tidyr) fgsc <

我对R比较陌生,刚过一年,对一些基本的东西有点执着

我有一个数据框架,其中包括一些植物病害数据、开花日期(日期)和进行评估的城镇(df1)。此外,还有一些特定地区和感兴趣年份的天气数据。我想将df1中的开花日期与df2中的相应日期合并,直到df1中添加的结束日期,但要以宽幅格式进行合并,以便进行相关性分析

事实上,我有15个地方有自己独特的开花日期和4个疾病变量

下面我放置了一个数据样本,从中我了解了如何合并两个df

library(dplyr)
library(tidyr)

fgsc <- runif(10, min = 4, max = 74)                #amount of DNA measured 
don <- runif(10, min = 0, max = 10)                 #amoung of mt measured
date <- ymd(rep("2007-01-10", 10, length = 10))     #flowering date of plant
town <- c("Dover")                                  #locality of assessment 
df1 <- data.frame(town, date, fgsc, don) %>% 
  mutate(end_date = date + 70)                      #adding end date

df2 <- daily.all %>% 
  select(town, date, yy, doy, tmn, tmx, rh, ppt) %>% 
  filter(town == "Dover",
         yy == 2007)                                #weather data from locality for 2007 period

df3 <- df1 %>% full_join(df2) %>%                          #joining two dfs
  pivot_wider(id_cols = c("town", "date", "fgsc", "don"), 
              names_from = doy,
              values_from = c(tmx, tmn, rh, ppt),
              names_glue = "{.value}_{doy}")        #making df wide for correlations 

head(df3)
town    date        fgsc        don         tmx_10  tmx_1  tmx_2   tmx_3
Dover   2007-01-10  30.528472   9.5728950   31.44   NA     NA      NA       
Dover   2007-01-10  37.632146   0.1133579   31.44   NA     NA      NA   
Dover   2007-01-10  8.680817    2.4340275   31.44   NA     NA      NA       
Dover   2007-01-10  63.585375   2.9233743   31.44   NA     NA      NA   
Dover   2007-01-10  57.910708   5.5582542   31.44   NA     NA      NA   
Dover   2007-01-10  15.461667   6.6791987   31.44   NA     NA      NA   
库(dplyr)
图书馆(tidyr)
fgsc