我如何查询SNP的遗传学数据库（最好使用R）？

从几个人类单核苷酸多态性（SNPs）开始，我如何查询所有已知SNPs的数据库，以便生成1000个左右最接近的SNPs的列表（data.table或csv文件），SNP是否为tagSNP，次要等位基因频率（MAF）是多少，以及它与起始SNPs之间的碱基距离是多少

我更愿意在R中这样做（尽管不一定要这样）。我应该使用哪个数据库？我唯一的出发点是列出起始SNP（如rs3091244、rs6311等）

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我确信有一个简单的生物导体封装可以作为我的出发点。但是什么呢？你做过吗？我想大概需要3到5行代码就可以完成。

这又是一个离题的话题，但实际上你可以通过这个基于web的工具从广义上完成你提到的所有事情：

您只需输入一个snp，它会为您提供周围的snp窗口，您还可以导出到csv

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祝你的遗传学项目好运

因为这不是一个真正的编程问题，它不属于这个网站。@nograps我试图搜索Stackexchange，看看什么是最好的网站，它要么在这里，要么在生物学上。它是两者的接口。对于生物学来说，数据/数据库太多了，对于编程来说太简单了。它实际上不是两者的接口，它主要是关于寻找一个不属于本网站的数据库。如果您不能发布一些数据、代码和问题，那么它可能不属于堆栈溢出。关于“Open data.SXC”如何？有人提醒我应该发布的绝对明显的位置：。我已经忘记了biostars，因为它不再是stackexchange的一部分。很抱歉