Warning: file_get_contents(/data/phpspider/zhask/data//catemap/4/r/65.json): failed to open stream: No such file or directory in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 167

Warning: Invalid argument supplied for foreach() in /data/phpspider/zhask/libs/tag.function.php on line 1116

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Warning: array_chunk() expects parameter 1 to be array, null given in /data/phpspider/zhask/libs/function.php on line 181
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R 集群与热图的关联

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R 集群与热图的关联,r,ggplot2,heatmap,heatmaply,R,Ggplot2,Heatmap,Heatmaply,我有两个独立的数据框，从其中一个我已经从第一个数据框创建了一个热图，但是我想添加一个侧栏，指示一个基因实际上与之相关的家族类型 数据帧1 数据框架2 热图创建： p3 <- heatmap.3(comat, scale = "none", trace = "none", col = color, main="GCF Co-Occurrence Map" ,lhei=c(0.5,1), keysize=0.5, cexRow = 0.60, cexCol

我有两个独立的数据框，从其中一个我已经从第一个数据框创建了一个热图，但是我想添加一个侧栏，指示一个基因实际上与之相关的家族类型

数据帧1 数据框架2 热图创建：

p3 <- heatmap.3(comat, scale = "none", trace = "none", col = color,  main="GCF Co-Occurrence Map"
                ,lhei=c(0.5,1),  keysize=0.5, cexRow = 0.60, cexCol = 0.65)

p3查看heatmaply手册中的“使用RowSideColor基于其他因素添加注释”一节：




x

BGC1     Association  
----------------------------------
BGC31     Skin Cancer
BGC34     Skin Cancer     
BGC34     Lung Cancer     
BGC53     Liver Cancer



p3 <- heatmap.3(comat, scale = "none", trace = "none", col = color,  main="GCF Co-Occurrence Map"
                ,lhei=c(0.5,1),  keysize=0.5, cexRow = 0.60, cexCol = 0.65)



x  <- as.matrix(datasets::mtcars)
rc <- colorspace::rainbow_hcl(nrow(x))

heatmaply(
  x[, -c(8, 9)],
  seriate = "mean",
  col_side_colors = c(rep(0, 5), rep(1, 4)),
  row_side_colors = x[, 8:9]
)