R中的正则分析

我使用下面的代码在R中的vegan软件包中获得规范分析中的图。我得到的图是轴1和轴2。如何获得轴1和轴3的绘图

library (vegan)  
e.data= read.csv (file.choose())
e.data.ca <- cca(e.data)
plot(scores(e.data.ca,display="sites"),type="p", cex=3*log(rowSums(e.data)/max(log(rowSums(e.data))))
text (scores(e.data.ca,display="sites"),row.names(e.data))

我得到以下错误：

错误：中出现意外符号：

"plot(scores(e.data.ca,display="sites"),type="p", choices=c(1,3),  cex=3*log(rowSums(e.data)/max(log(rowSums(e.data))))
    plot"

警告信息：

1: In plot.window(...) : "choices" is not a graphical parameter
2: In plot.xy(xy, type, ...) : "choices" is not a graphical parameter
3: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :

“选择”不是一个图形参数 4：在轴中（侧=侧，at=at，标签=标签，…）： “选择”不是一个图形参数 5:框（…）：“选项”不是图形参数 6:在标题（…）：“选项”不是图形参数

---

任何提示都将非常感谢，因为“选择”不是图形参数，即它不是

plot

接受作为参数的参数之一。你想通过包含这个论点来实现什么？我想展示物种在轴1和轴3上的分布模式。在规范分析中是否有R代码可以显示这一点？您对

choices

的调用需要进入

scores

函数的内部，而不是

plot

，例如

plot（scores（e.data.ca，choices=c（1,3））。

不使用

scores（）

，而是直接

plot

排序结果对象：

plot（e.data.ca，display=“sites”，type=“p”，choices=c（1,3），cex=3*log（rowSums（e.data）/max（log（rowSums（e.data）））

。这将使用函数

vegan:：：plot.cca（）

了解

选项的
vegan:：scores.cca（）
函数也知道
选项
就像某些答案中所说的那样，但直接绘制排序结果仍然比通过
分数循环更可取
1: In plot.window(...) : "choices" is not a graphical parameter
2: In plot.xy(xy, type, ...) : "choices" is not a graphical parameter
3: In axis(side = side, at = at, labels = labels, ...) :