R 从事件列表计算协方差矩阵
我有以下数据框:R 从事件列表计算协方差矩阵,r,covariance,R,Covariance,我有以下数据框: # my_data id cg 1 a 2 b 3 a 3 b 4 b 4 c 5 b 5 c 5 d 6 d 我想计算cg值的协方差。我相信我可以通过在下面的矩阵中使用cov()来获得它,其中每个单元格计算cg两个值之间的共现次数 # my_matrix cg a b c d a 2 1 0 0 b 1 4 2 1 c 0 2 2 1 d 0 1 1 2 从my_data到my_ma
# my_data
id cg
1 a
2 b
3 a
3 b
4 b
4 c
5 b
5 c
5 d
6 d
我想计算cg
值的协方差。我相信我可以通过在下面的矩阵中使用cov()
来获得它,其中每个单元格计算cg
两个值之间的共现次数
# my_matrix
cg a b c d
a 2 1 0 0
b 1 4 2 1
c 0 2 2 1
d 0 1 1 2
从my_data
到my_matrix
的最快方式是什么?请注意,cg
包含700多个唯一值
如果有更好的方法生成协方差矩阵,我也对此感兴趣
以下是生成my_数据的代码:
my_data <- structure(list(id = c(1L, 2L, 3L, 3L, 4L, 4L, 5L, 5L, 5L, 6L),
cg = c("a", "b", "a", "b", "b", "c", "b", "c", "d", "d")),
.Names = c("id", "cg"),
class = "data.frame", row.names = c(NA, -10L))
my_data我们可以将crossprod
与table
crossprod(table(my_data))
# cg
#cg a b c d
# a 2 1 0 0
# b 1 4 2 1
# c 0 2 2 1
# d 0 1 1 2
我准备了一个解决方案,并将其发布在dupe链接上,因为它在您的解决方案生效之前就被删除了。非常感谢。但我现在对原始问题进行了编辑,使得此解决方案不再适用。@Michele请将其作为新问题发布,因为答案基于您的原始帖子。好的。新问题在这里:@Michele谢谢,我会查出来的