Regex 如何使用Linux命令提取Fasta文件中的部分头

我有一个具有唯一头的Fasta文件，我想在Unix中使用正则表达式提取该头的一部分

例如，我的Fasta文件以以下标题开头：

>jgi|Penbr2|47586|fgenesh1_pm.1_#_25  

我只想提取标题的最后一部分，如：

>fgenesh1_pm.1_#_25

实际上，我在vim editor中使用了这个正则表达式，但它不起作用：

:%s/^([^|]+\|){3}//g

或

---

如果给我一些建议，我会很合适。

您可以使用

sed

：

sed -e 's/>.*|/>/' fasta-file

---

i、 e.

和

|

之间的所有内容都将替换为

您可以使用

sed

：

sed -e 's/>.*|/>/' fasta-file

---

i、 e.

和

|

之间的所有内容都被

替换为

我不知道前面的
是否也是您文本的一部分。假设他们不是

既然您标记了
vim
，那么我就发布vim解决方案

您可以使用regex的“贪婪”：

在vim中：

%s/.*|//

离开最后一部分，这是最简单的方法

在vim中，您也可以使用
\zs、\ze
和
非贪婪匹配：

%s/\zs.\{-}\ze[^|]\+$//

当然，如果您喜欢分组，可以使用
\（…\）
进行分组，而不使用
\zs\ze

在代码中，只使用
（…）
进行分组，而不进行转义。我不知道您是如何在vimrc中配置
magic
设置的，如果您使用默认设置，您必须退出
（和）
，以赋予它们特殊的含义（在这里分组）。就像我们用BRE做的一样。执行一个
：h magic
，然后找到表格以了解差异

在vim do
：h terms
中获取详细信息。
我不知道前导的
是否也是文本的一部分。假设他们不是

既然您标记了
vim
，那么我就发布vim解决方案

您可以使用regex的“贪婪”：

在vim中：

%s/.*|//

离开最后一部分，这是最简单的方法

在vim中，您也可以使用
\zs、\ze
和
非贪婪匹配：

%s/\zs.\{-}\ze[^|]\+$//

当然，如果您喜欢分组，可以使用
\（…\）
进行分组，而不使用
\zs\ze

在代码中，只使用
（…）
进行分组，而不进行转义。我不知道您是如何在vimrc中配置
magic
设置的，如果您使用默认设置，您必须退出
（和）
，以赋予它们特殊的含义（在这里分组）。就像我们用BRE做的一样。执行一个
：h magic
，然后找到表格以了解差异

在vim do
：h terms
中获取详细信息。
尝试
s/^\（[^ 124;]*.\+//g
。我也尝试了这个命令，但它找不到模式Try
s/^\（[^ 124;]*.\+//g
。我也尝试了这个命令，但它找不到模式