Regex 使用sed更改文件中的事件时出现问题

我有一个文件，其中有几行：

OTU3055 UniRef90_A0A0F7KBB1 UniRef90_A0A1Z9IPT2
OTU0856 OTU53699 UniRef90_D6PC25 UniRef90_D6PCA5 UniRef90_D6PCG3
OTU0125 UniRef90_A0A075FUN0 UniRef90_A0A075G8Q1 UniRef90_A0A075GDT2

我想删除文件中出现的所有OTUxxx事件（在“OTU”之后总是有4个数字）。我使用了

sed

，但它不起作用。OTUxxx始终出现在行的开头

sed的/OTU[0-9]{4}//g'my_file.txt

我在

OTU[0-9]{4}

后面放了一个空格，因为我希望Uniref90 id位于eacg行的开头

编辑：

sed-r的/OTU[0-9]{4}//g'my_file.txt。但我还有一个问题

UniRef90_A0A0F7KBB1 UniRef90_A0A1Z9IPT2
 UniRef90_D6PC25 UniRef90_D6PCA5 UniRef90_D6PCG3
UniRef90_A0A075FUN0 UniRef90_A0A075G8Q1 UniRef90_A0A075GDT2

有些行仍然以空格开头。我尝试了sed的/^*/'my_file.txt，但它不起作用。我希望文件的第二行与其他两行一样开始，没有任何空格。

您可以使用

sed -r 's/[[:space:]]*\bOTU[0-9]{4,}\b[[:space:]]*//g' file > newfile

或者，如果可以在任何地方找到匹配项，而不仅仅是在字符串开头：

sed -r 's/[[:space:]]*\bOTU[0-9]{4,}\b//g' file | sed 's/[[:space:]]*$//' > newfile

OTU

后面的空格将与第二个代码段不匹配，因此需要使用管道

sed

命令

看

详细信息

• [[：space:][]*

  -0+空格字符

• \b

  单词边界

• OTU[0-9]{4，}

  -

  OTU

  和4位或更多数字

• \b

  -单词边界

• [[：space:][]*

  -0+空格字符

---

鉴于您发布的输入和运行的命令，没有任何关于您发布的实际输出的解释，但是如果您希望匹配4位或更多数字，并且OTU*字符串后面的空格可以是一个制表符或一些其他非空字符的空白，那么这就是您需要使用GNU或OSX/BSD awk进行

-E

：

$ sed -E 's/(OTU[0-9]{4,}[[:space:]]+)+//' file
UniRef90_A0A0F7KBB1 UniRef90_A0A1Z9IPT2
UniRef90_D6PC25 UniRef90_D6PCA5 UniRef90_D6PCG3
UniRef90_A0A075FUN0 UniRef90_A0A075G8Q1 UniRef90_A0A075GDT2

---

将选项

-r

添加到GNU-sed。或者用\来转义两个花括号。我注意到前面的命令可以工作，但对于某些行，某些行开头的“空白”没有删除。它对一些人有效，但对其他人无效。你有什么想法吗？我尝试了sed的my_file.txt。试试

sed-r的//[:space:]*\bOTU[0-9]{4，}\b[:space:]*//g'文件

，检查。如果您使用

-E

而不是

-r

，那么它将在GNU和OSX/BSD sed中工作，而不仅仅是GNU sed。@EdMorton是的，对。