Sorting 按列表顺序对数据帧进行排序

因此，我有一个熊猫数据框架，df，其中的列表示分类分类（即王国、门、类等）。我还有一个分类标签列表，对应于我希望数据框架的排序顺序

列表如下所示：

class_list=['Gammaproteobacteria', 'Bacteroidetes', 'Negativicutes', 'Clostridia', 'Bacilli', 'Actinobacteria', 'Betaproteobacteria', 'delta/epsilon subdivisions', 'Synergistia', 'Mollicutes', 'Nitrospira', 'Spirochaetia', 'Thermotogae', 'Aquificae', 'Fimbriimonas', 'Gemmatimonadetes', 'Dehalococcoidia', 'Oscillatoriophycideae', 'Chlamydiae', 'Nostocales', 'Thermodesulfobacteria', 'Erysipelotrichia', 'Chlorobi', 'Deinococci']

---

此列表将对应于

Dataframe

列

df['Class']

。我想根据列表的顺序对整个数据帧的所有行进行排序，因为

df['Class']

当前的顺序不同。最好的方法是什么？

您可以将

类

列作为索引列

df = df.set_index('Class')

然后使用

df.loc

使用

class_list

重新索引数据帧：

df.loc[class_list]

最简单的例子：

>>> df = pd.DataFrame({'Class': ['Gammaproteobacteria', 'Bacteroidetes', 'Negativicutes'], 'Number': [3, 5, 6]})
>>> df
                 Class  Number
0  Gammaproteobacteria       3
1        Bacteroidetes       5
2        Negativicutes       6

>>> df = df.set_index('Class')
>>> df.loc[['Bacteroidetes', 'Negativicutes', 'Gammaproteobacteria']]
                     Number
Bacteroidetes             5
Negativicutes             6
Gammaproteobacteria       3

---

如果原始数据帧不包含有序列表中的所有元素，Alex的解决方案将无法工作，即：如果某个时间点的输入数据不包含“NegativeCutes”，则此脚本将失败。解决这个问题的一种方法是将df附加到一个列表中，并在末尾连接它们。例如：

ordered_classes = ['Bacteroidetes', 'Negativicutes', 'Gammaproteobacteria']

df_list = []

for i in ordered_classes:
   df_list.append(df[df['Class']==i)

ordered_df = pd.concat(df_list)

---

为了获得更好的通用性，请使用

df=df.reindex（一些列表）

，有关重新索引步骤，请参阅。虽然

DataFrame.loc[]

主要是基于标签的，但它也可以与布尔数组一起使用，如详细说明所示。因此，如果索引最终是布尔的，并且您尝试使用

df=df.loc[[True，False]]

重新编制索引，那么您将抛出第二行。看见