使用IPython笔记本（带rdflib？）记录SPARQL查询和结果

我想使用IPython笔记本一起记录SPARQL查询 这些查询的结果

因为任何命令行工具都可以从IPython笔记本调用 “砰”的一声，我当然可以跑：

!arq --data dcterms.ttl --query test1.rq

或者使用roqet，我甚至可以在命令本身中嵌入一个简短的查询：

!roqet -i sparql -e ’SELECT * WHERE { ?s ?p ?o }’ -D dcterms.rdf

arq或roqet都不接受多行SPARQL查询作为参数。任何疑问 超过一行的长度必须存储在一个文件中（例如，如上所述的“test1.rq”）

最好是直接在IPython笔记本中定义SPARQL查询 细胞，在那里他们可以很容易地被克隆和调整。以下工作：

In [4]:   myquery = """
          PREFIX rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
          CONSTRUCT
          WHERE {?s rdf:type ?o}
          """

In [5]:   def turtleme(myquery):
              import rdflib
              g = rdflib.Graph()
              g.parse('dcam.rdf')
              results = g.query(myquery)
              print results.serialize(format="turtle")

In [6]:   turtleme(myquery)

Out [6]:  @prefix rdf: <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#> .
          @prefix rdfs: <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#> .
          @prefix xml: <http://www.w3.org/XML/1998/namespace> .
          @prefix xsd: <http://www.w3.org/2001/XMLSchema#> .

          <http://purl.org/dc/dcam/VocabularyEncodingScheme> a rdfs:Class .
          <http://purl.org/dc/dcam/memberOf> a rdf:Property .

我在谷歌搜索了使用IPython笔记本和SPARQL的例子 但是找不到。这似乎是一个明显的环境设计用途 数据探索。我发现唯一有效的方法就是运行 arq，但我们需要这样做

        !cat test3.rq

将查询粘贴到IPython笔记本，实现 记录探索数据的过程，但查询必须在 与笔记本平行，作为单独的文件。我的目标是成功 初学者使用SPARQL和record轻松探索RDF数据 他们的探索记录在笔记本上。一定有更好的办法

更新：

@Joshua Taylor，@AndyS指出，这些命令接受多行查询 作为论据。这在bash提示符下可以正常工作，但不幸的是不能 在IPython笔记本中，它抛出一个语法错误：

In [5]:   !arq --data dcam.ttl '
          PREFIX rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
          PREFIX dcam:    <http://purl.org/dc/dcam/>
          PREFIX rdfs:    <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

          SELECT ?s ?p ?o WHERE { ?s ?p ?o . }'

Out [5]:  File "<ipython-input-5-c9328c1c0c64>", line 2
          PREFIX rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
                   ^
          SyntaxError: invalid syntax

[5]中的

：！arq—数据dcam.ttl'
前缀rdf：
前缀dcam：
前缀rdfs：
选择s？p？o，其中{s？p？o.}'
Out[5]：文件“”，第2行
前缀rdf：
^
SyntaxError:无效语法

如果我逃出第1行的末尾，如

In [5]:   !arq --data dcam.ttl '\
          ...

Out [5]:  File "<ipython-input-18-313c556abc1d>", line 2
          PREFIX dcam:    <http://purl.org/dc/dcam/>
                    ^
          SyntaxError: invalid syntax

[5]中的

：！arq—数据dcam.ttl'\
...
Out[5]：文件“”，第2行
前缀dcam：
^
SyntaxError:无效语法

但是，我无法通过转义所有 线的两端

因此，问题可能不在于arq和roqet如何在线处理查询，而在于

---

如何将这些arq和roqet命令行传递给IPython笔记本？

sparql/arq和roqet都可以接受多行查询；你只需要适当地引用它们。下面是一个例子：

$ cat data.n3
@prefix : <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/> .

:sparql :accepts :multiLineQueries.
:roqet :accepts :multiLineQueries.

$cat data.n3
@前缀：。
：sparql:accepts:multilequiries。
：roqet:accepts:multilequeries。

$roqet-D data.n3-e'
选择s？p？o何处{
？s？p？o
}'
roqet:正在运行查询'
选择s？p？o何处{
？s？p？o
}'
roqet:查询具有变量绑定结果
结果：[s=uri，p=uri，o=uri]
结果：[s=uri，p=uri，o=uri]
roqet:查询返回了2个结果

$sparql--data.n3'
选择s？p？o何处{
？s？p？o
}'
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
|s|p|o|
=================================================================================================================================================================================
|   |  |  |
|  |  |  |
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

在IPython笔记本中，在shell命令前面加上“砰”（！）将 适用于大多数命令（例如“！date”），但如上所述，多行 命令传递不正确。根据

IPython有一个

%%脚本

cell magic，可以让您在 系统上任何解释器的子进程，例如：bash、ruby、， perl、zsh、R等

它甚至可以是您自己的脚本 输入标准输入

要使用它，只需向 要在

%%script

行和单元格的其余部分上运行的程序 将由该脚本运行，并且子流程中的stdout/err是 捕获并显示

因此，要正确地传递查询，IPython笔记本单元必须以

%%script bash

（或仅

%%bash

），如下所示：

[5]中的

：%%脚本bash
arq—数据dcam.ttl'
前缀rdf：
前缀dcam：
前缀rdfs：
构造
其中{s rdf:type？o.}'

roqet可以使用

-e

接受多行查询。有关示例，请参见。因为它接受多行查询，并且您可以在命令行上指定数据文件，所以它似乎可以处理所有事情？当您说您正在寻找一种至少能够

turtleme（'dcam.ttl'，myquery）

的方法时，您是说

def turtleme（path，query）…g.parse（path）…g.query（query）…

doesnt't work？arq接受对命令的查询，如（不使用--file）和多行查询（这是对！行的引用问题，而不是命令本身）。@AndyS我认为是这样的，但在

--help

输出中没有看到它的选项，这表示用法是

查询--data=--query=

。啊，但是

arq

的输出是

没有查询字符串或查询文件

，并且

arq'select*{…}'

是预期的。所以arq/sparql也可以接受多行查询。@JoshuaTaylor-感谢您指出arq和roqet可以将多行查询作为命令行参数。这在bash中有效，但在IPython笔记本中不起作用（请参见上面添加的详细信息）。因此，也许问题真的与外部shell命令如何从IPython笔记本传递到shell有关？知道arq可以接受多行SPARQL查询非常好

In [5]:   !arq --data dcam.ttl '\
          ...

Out [5]:  File "<ipython-input-18-313c556abc1d>", line 2
          PREFIX dcam:    <http://purl.org/dc/dcam/>
                    ^
          SyntaxError: invalid syntax

$ cat data.n3
@prefix : <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/> .

:sparql :accepts :multiLineQueries.
:roqet :accepts :multiLineQueries.

$ roqet -D data.n3 -e '
select ?s ?p ?o where {
  ?s ?p ?o
}'
roqet: Running query '
select ?s ?p ?o where {
  ?s ?p ?o
}'
roqet: Query has a variable bindings result
result: [s=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/sparql>, p=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/accepts>, o=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/multiLineQueries>]
result: [s=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/roqet>, p=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/accepts>, o=uri<http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/multiLineQueries>]
roqet: Query returned 2 results

$ sparql --data data.n3 '
select ?s ?p ?o where {
  ?s ?p ?o
}'
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
| s                                                    | p                                                     | o                                                              |
=================================================================================================================================================================================
| <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/roqet>  | <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/accepts> | <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/multiLineQueries> |
| <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/sparql> | <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/accepts> | <http://stackoverflow.com/q/24337235/1281433/multiLineQueries> |
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

In [5]:  %%script bash
         arq --data dcam.ttl '
         PREFIX rdf:     <http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>
         PREFIX dcam:    <http://purl.org/dc/dcam/>
         PREFIX rdfs:    <http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#>

         CONSTRUCT
         WHERE { ?s rdf:type ?o . }'