String 对各种位字符串的模式搜索

我有以下问题： 给定每个1024位的15位字符串，在同一位置的不同字符串中查找模式的最佳方法是什么？模式看起来如何对我来说并不重要（当然长度>1），我只想找到至少两个字符串匹配的部分（尽可能长）。 例如：

• 10010
• 00011
• 00101

这里我想从前两个字符串中得到001（位置2到4，频率2也很好…），从第二个和第三个字符串中得到00（位置1到2）

我希望，问题现在清楚了。。。有人有主意吗？

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谢谢

我会尝试用两步法解决你的问题。因为您只有15个位字符串，所以比较所有对的位字符串就足够了（105个比较和16个QWORDS应该是可行的）

现在，我还将考虑长度为1的模式，稍后我们将看看如何去掉这一点。既然您没有提到编程语言，我将尽量保持它的通用性，并使用C语法进行位操作。设

a

和

b

为两个位字符串

识别可能的模式：当且仅当

a[i]==b[i]

时，

i

第位是模式的一部分。我们可以通过计算按位异或（对应于

！=

）并求反：

模式=~（a^b）

识别最长模式：计算上述转换后，

a

和

b

之间的公共模式是

模式中连续的1。例如，可以通过反复换档和和操作来解决查找如此长的模式的问题，有关详细信息，请参阅。如果您希望得到很长的序列，我会尝试使用一些专用的指令来查找非模式位，如果需要，我将扩展答案

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如果这是真正的高通量代码，您可以尝试同时进行多个比较，即使用SIMD指令，但这是另一个问题的主题。

您好，欢迎来到Stack Overflow，请花点时间浏览一下以了解您在这方面的做法（以及赢得您的第一个徽章），阅读如何创建和检查，以增加获得反馈和有用答案的机会。如果将它们视为字符串并尝试查找常见的最长子字符串，会怎么样？这方面有很多算法。如果长度不是太长，你也可以使用蛮力，但我想找到两个字符串中位于相同位置的所有公共子字符串。我不明白你的方法是如何解决这个问题的……请再澄清一点。让我们在您的示例中再添加两个字符串：10011，10000。然后，对于位置2的模式001，您希望它转储出{10010010010011，00011}，但不转储较小的子集，如{10010010010011，00011}或{00011，10011}？还是你也要后者？您是否还希望它输出与位置2处的00匹配的{00011，10000}，还是因为位置2处的图案长度小于001图案，所以不感兴趣？或者它不感兴趣，因为这里只有两个匹配字符串，而另一个有3个？你说的“最佳”是什么意思？最快的？您需要的只是一个编程语言中立的算法，还是您心中有一种特定的语言？我可以想出几个解决这个问题的办法，但你需要缩小你的问题的范围。输入是否具有特殊属性，还是完全随机？