Tcl 无法使用catdcd工具连接VMD中的dcd文件

我有一组dcd文件，我希望有一个（长）dcd文件。我在VMD Tkconsole（VMD版本：1.9.2）中输入了以下代码：

catdcd -o output.dcd -i indexFile.ind input1.dcd input2.dcd input3.dcd 

我犯了以下错误：

wrong # args: should be "catdcdList dcdFileNames outFile indexFile stride"

于是我写道：

catdcdList -d input1.dcd input2.dcd input3.dcd -o output.dcd -i indexFile.ind -s 1

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即使重新识别了

catdcdList

命令（绿色），我仍然有完全相同的错误消息。我尝试对我的请求进行一些更改，但我一直收到上面的错误消息。来自的第二个示例也不起作用。

我的ubuntu 15.10笔记本电脑上的catdcd也有同样的问题

为了让它工作，我将catdcd目录添加到我的路径中

如何执行此操作（注意，我的说明将catdcd永久添加到路径）：

1） 转到/home/user目录。使用ls-a命令，您应该会看到一个名为.bashrc的文件（不要忘记“.”；这很重要，并且意味着该文件是一个隐藏文件）

2） 使用gedit（或类似的文本编辑器）打开.bashrc。如果需要，可以备份.bashrc（例如cp.bashrc./.bashrcbkup）

3） 在.bashrc的末尾，附加以下内容：

export PATH=“/usr/local/lib/vmd/plugins/LINUXAMD64/bin/catdcd5.1:$PATH” 此目录是配置VMD 1.9.2时安装的默认目录。请注意，您可能安装了不同版本的catdcd（如来自VMD网站的catdcd4.0）。在任何情况下，您都需要在计算机上找到与catdcd文件对应的目录

4） 再次关闭并打开终端。键入$PATH命令以确保此目录现在存在

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5） 您应该能够在终端中键入“catdcd”（无需打开vmd），现在它应该能够识别该命令。您还应该能够在tkconsole中使用catdcd，但我发现它在终端中更容易使用。

看起来它希望第一个参数是一个列表，并且没有选项：

catdcdList{input1.dcd input2.dcd input3.dcd}output.dcd indexFile.ind 1

这也不起作用。我试着把剩下的文件放在两个拥抱之间，但仍然不起作用。我重新安装了vmd软件包。现在catdcd已被识别。但是，当我键入

catdcd input1.dcd input2.dcd-o test.dcd

时，出现以下错误：

错误：input2.dcd已经存在。catdcd将不会运行，因为这将附加到此文件。