Awk 基于2列替换列匹配中的velues_Awk

Awk 基于2列替换列匹配中的velues

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Awk 基于2列替换列匹配中的velues,awk,Awk,我有一个文件f1，看起来像这样：（有1651行）我有文件f2，看起来像（有1651行）我想替换f1中的第6列，使其与f2 os的第3列相匹配，第1列和第2列与之匹配输出如下所示： fam0110 G110 0 0 0 2 T G fam6106 G6106 0 0 0 1 T T fam1000 G1000 0 0 0 1 T T 我试着用： awk 'FNR==NR{a[NR]=$3;next}{$6=a[FNR]}1' pheno_laser2 chr9.plink.ped >

我有一个文件f1，看起来像这样：（有1651行）

我有文件f2，看起来像（有1651行）

我想替换f1中的第6列，使其与f2 os的第3列相匹配，第1列和第2列与之匹配

输出如下所示：

fam0110 G110 0 0 0 2 T G
fam6106 G6106 0 0 0 1 T T
fam1000 G1000 0 0 0 1 T T

我试着用：

awk 'FNR==NR{a[NR]=$3;next}{$6=a[FNR]}1' pheno_laser2 chr9.plink.ped > chr9.new.ped

但是这不起作用，因为行的排序方式不同，所以我需要通过两个文件中第一列和第二列中的值进行匹配

请告知

这不起作用，因为您只需要在哈希中使用前两个字段，因为您只想匹配它们，而不想匹配行号或其他任何内容

awk 'FNR==NR{a[$1, $2]=$3;next} {$6=a[$1, $2]}1' file2 file1

使用您的示例进行测试：

fam0110 G110 0 0 0 2 T G
fam6106 G6106 0 0 0 1 T T
fam1000 G1000 0 0 0 1 T T

请注意，它会为任何不匹配的行打印空字段，我认为这是可以的

awk 'FNR==NR{a[$1, $2]=$3;next} {$6=a[$1, $2]}1' file2 file1

fam0110 G110 0 0 0 2 T G
fam6106 G6106 0 0 0 1 T T
fam1000 G1000 0 0 0 1 T T