Awk 使用#SBATCH向多个文件（900+；）添加列

我正在尝试向文件中添加列：

1       12098   12258   0.00
1       12553   12721   1.37
1       13331   13701   34.69
1       30334   30503   0.00
1       35045   35544   0.00
1       35618   35778   0.00
1       69077   70017   0.24
1       324294  324394  0.68
1       324427  325605  3.18

看起来是这样的：

1       12098   12258   unknown   0.00
1       12553   12721   unknown   1.37
1       13331   13701   unknown   34.69
1       30334   30503   unknown   0.00
1       35045   35544   unknown   0.00
1       35618   35778   unknown   0.00
1       69077   70017   unknown   0.24
1       324294  324394  unknown   0.68
1       324427  325605  unknown   3.18

我已使用以下命令成功完成此操作：

awk '$3 = $3 FS "unknown"' <file> > <new_file>

awk'$3=$3 FS“未知”>

然而，我有900多个文件，我也需要这样做，并在每次输出到一个新的文件。我发现awk很难理解，我想知道是否有一种方法可以使用#SBATCH脚本或任何其他方法一次处理多个文件

我对stack overflow还不太熟悉，所以非常感谢您的帮助！谢谢大家!

编辑：根据OP的注释添加解决方案，以将输出保存到输出文件。请尝试以下操作

awk '
FNR==1{
  close(out_file)
  sub(/\./,"_new&",FILENAME)
  out_file=FILENAME
}
{
  $NF="unknown" OFS $NF
  print > (out_file)
}'  *.bed

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file

---

---

如果你不担心行与行之间的间距，那么你可以尝试以下操作

awk '
FNR==1{
  close(out_file)
  sub(/\./,"_new&",FILENAME)
  out_file=FILENAME
}
{
  $NF="unknown" OFS $NF
  print > (out_file)
}'  *.bed

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file

或使用GNU

awk

最新版本，请尝试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file(s)

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

---

---

为了使空格看起来更美观，您也可以将

列
添加到上述命令中：

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

或使用GNU
awk
最新版本，请尝试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file(s)

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

编辑：根据OP的注释添加解决方案以将输出保存到outputfiles尝试以下操作

awk '
FNR==1{
  close(out_file)
  sub(/\./,"_new&",FILENAME)
  out_file=FILENAME
}
{
  $NF="unknown" OFS $NF
  print > (out_file)
}'  *.bed

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file



如果你不担心行与行之间的间距，那么你可以尝试以下操作

awk '
FNR==1{
  close(out_file)
  sub(/\./,"_new&",FILENAME)
  out_file=FILENAME
}
{
  $NF="unknown" OFS $NF
  print > (out_file)
}'  *.bed

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file

或使用GNU
awk
最新版本，请尝试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file(s)

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t



为了使空格看起来更美观，您也可以将
列
添加到上述命令中：

awk '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

或使用GNU
awk
最新版本，请尝试：

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file(s)

gawk -i inplace -v INPLACE_SUFFIX=.bak '{$NF="unknown" OFS $NF} 1'  Input_file | column -t

下面是一个替代的
sed
解决方案，用于进行此更改并以内联方式保存更改：

sed -E -i.bak 's/[^[:blank:]]+$/unknown &/' *.txt

下面是一个替代的
sed
解决方案，用于进行此更改并以内联方式保存更改：

sed -E -i.bak 's/[^[:blank:]]+$/unknown &/' *.txt

谢谢你的建议。我想对多个文件同时执行此操作有没有方法？Thanks@hdjc90，如果您有最新版本的GNU awk，它也有就地保存和文件备份，请删除备份文件选项
-v inplace_SUFFIX=.bak
如果您不想备份文件，请告诉我？您好@RavinderSingh13谢谢您的帮助。为了澄清，我想输入一个命令来执行我的所有文件（例如.*.bed）并输出它们（例如..*u new.bed）？@hdjc90，请检查我的编辑解决方案，让我知道这是否对您有帮助？谢谢您的建议。我想对多个文件同时执行此操作有没有方法？Thanks@hdjc90，如果您有最新版本的GNU awk，它也有就地保存和文件备份，请删除备份文件选项
-v inplace_SUFFIX=.bak
如果您不想备份文件，请告诉我？您好@RavinderSingh13谢谢您的帮助。为了澄清，我想输入一个命令来处理我的所有文件（例如.*.bed）并将它们全部输出（例如..*u new.bed）？@hdjc90，请检查我的编辑解决方案，让我知道这是否有帮助？保留列之间的间距对您重要吗？如果是这样的话，是制表符、空格还是其他什么？保留列之间的间距对您来说重要吗？如果是这样的话，那是标签、空白还是其他什么？嗨@anubhava，谢谢你！它工作得很好。我想知道是否可以只对单独文件中列出的文件名执行此命令？感谢阿加因特说文件名存储在一个名为
files.txt
的文件中，然后你可以使用：
sed-E-i.bak的/[^[：blank:][]+$/unknown&/'$（太棒了！感谢@anubhava工作得很好！最后一个问题，你能让sed在后台工作吗？是的，把
&
放在命令的末尾，比如：
sed-E-i.bak's/[^[：blank:]+$/unknown&/'$（嗨@anubhava，谢谢你！它工作得很好。我想知道是否可以只对单独文件中列出的文件名执行此命令？感谢Againer的说法，文件名存储在名为
files.txt
的文件中，然后你可以使用：
sed-E-I.bak's/[^[：blank:]+$/unknown&/'$（太棒了！谢谢@anubhava工作得很好！最后一个问题，你能让sed在后台工作吗？是的，把
&
放在命令的末尾，比如：
sed-E-i.bak的/[^[：blank:]+$/unknown&/'$(