从文件BASH对列进行排序

我有下面的shell脚本，它从命令行输入的文件中读取数据。该文件是一个数字矩阵，我需要按列分隔该文件，然后对列进行排序。现在我可以读取文件并输出各个列，但我不知道如何排序。我输入了一个sort语句，但它只对第一列进行排序

编辑： 我已经决定采用另一种方法，实际转置矩阵，将列转换成行。由于我以后必须计算平均值和中位数，并且在脚本的前面已经成功地对文件行进行了计算，因此建议我尝试“旋转”矩阵，如果您想将列转换为行的话

这是我的更新的代码

     declare -a col=( )
     read -a line < "$1"
     numCols=${#line[@]}                          # save number of columns

     index=0
     while read -a line ; do
     for (( colCount=0; colCount<${#line[@]}; colCount++ )); do
      col[$index]=${line[$colCount]}
      ((index++))
     done
     done < "$1"

     for (( width = 0; width < numCols; width++ )); do
      for (( colCount = width; colCount < ${#col[@]}; colCount += numCols )    ); do

       printf "%s\t" ${col[$colCount]}
     done
    printf "\n"
   done

尽管我现在正在寻找：

    1 3 3 6 6 9
    1 3 4 4 6 7
    1 2 4 4 8 8
    1 1 5 7 9 9
    1 1 4 5 7 7

为了尝试对数据进行排序，我尝试了以下方法：

    sortCol=${col[$colCount]}
    eval col[$colCount]='($(sort <<<"${'$sortCol'[*]}"))'

如果您能就此提供任何见解，我们将不胜感激

Awk脚本

awk '
{for(i=1;i<=NF;i++)a[i]=a[i]" "$i}      #Add to column array
END{
        for(i=1;i<=NF;i++){
                split(a[i],b)          #Split column
                x=asort(b)             #sort column
                for(j=1;j<=x;j++){     #loop through sort
                        d[j]=d[j](d[j]~/./?" ":"")b[j]  #Recreate lines
                }
        }
for(i=1;i<=NR;i++)print d[i]          #Print lines
}' file

---

注意，正如评论中提到的，纯bash解决方案并不漂亮。有很多方法可以做到这一点，但这可能是最直接的方法。以下要求将每行的所有值读取到数组中，并保存矩阵

stride

，以便将所有列值转换为行矩阵并进行排序。所有已排序的列都插入新行矩阵

a2

。换位该行矩阵将以列排序顺序返回原始矩阵

注意这将适用于文件中任何列矩阵等级

#!/bin/bash

test -z "$1" && {           ## validate number of input
    printf "insufficient input. usage:  %s <filename>\n" "${0//*\//}"
    exit 1;
}

test -r "$1" || {           ## validate file was readable
    printf "error: file not readable '%s'. usage:  %s <filename>\n" "$1" "${0//*\//}"
    exit 1;
}

## function: my sort integer array - accepts array and returns sorted array
## Usage: array=( "$(msia ${array[@]})" )
msia() {
    local a=( "$@" )
    local sz=${#a[@]}
    local _tmp
    [[ $sz -lt 2 ]] && { echo "Warning: array not passed to fxn 'msia'"; return 1; }
    for((i=0;i<$sz;i++)); do
        for((j=$((sz-1));j>i;j--)); do
        [[ ${a[$i]} -gt ${a[$j]} ]] && {
            _tmp=${a[$i]}
            a[$i]=${a[$j]}
            a[$j]=$_tmp
        }
        done
    done
    echo ${a[@]}
    unset _tmp
    unset sz
    return 0
}

declare -a a1               ## declare arrays and matrix variables
declare -a a2
declare -i cnt=0
declare -i stride=0
declare -i sz=0

while read line; do         ## read all lines into array
    a1+=( $line );
    (( cnt == 0 )) && stride=${#a1[@]}  ## calculate matrix stride
    (( cnt++ ))
done < "$1"

sz=${#a1[@]}                ## calculate matrix size
                            ## print original array
printf "\noriginal array:\n\n"
for ((i = 0; i < sz; i += stride)); do
    for ((j = 0; j < stride; j++)); do
        printf " %s" ${a1[i+j]}
    done
    printf "\n"
done

                            ## sort columns from stride array
for ((j = 0; j < stride; j++)); do
    for ((i = 0; i < sz; i += stride)); do
        arow+=( ${a1[i+j]} )
    done
    a2+=( $(msia ${arow[@]}) )  ## create sorted array
    unset arow
done
                            ## print the sorted array
printf "\nsorted array:\n\n"
for ((j = 0; j < cnt; j++)); do
    for ((i = 0; i < sz; i += cnt)); do
        printf " %s" ${a2[i+j]}
    done
    printf "\n"
done

exit 0

---

这是我在这个小练习中的词条。应处理任意数量的列。我假设它们是空间分隔的：

#!/bin/bash

linenumber=0
while read line; do
        i=0
        # Create an array for each column.
        for number in $line; do
                [ $linenumber == 0 ] && eval "array$i=()"
                eval "array$i+=($number)"
                (( i++ ))
        done    
        (( linenumber++ ))
done <$1
IFS=$'\n'
# Sort each column
for j in $(seq 0 $i ); do
        thisarray=array$j
        eval array$j='($(sort <<<"${'$thisarray'[*]}"))'
done    
# Print each array's 0'th entry, then 1, then 2, etc...
for k in $(seq 0 ${#array0[@]}); do
        for j in $(seq 0 $i ); do
                eval 'printf ${array'$j'['$k']}" "'
        done    
        echo "" 
done

#/bin/bash
行号=0
读行时；做
i=0
#为每列创建一个数组。
对于$行中的数字；做
[$linenumber==0]&&eval“数组$i=（）”
eval“数组$i+=（$number）”
（（i++）
完成
（（行号++））
完成不是
bash
，但我认为这段
python
代码值得一看，它展示了如何使用内置函数来完成这项任务

从
解释器
：

$ cat matrix.txt 
1 1 1 1 1
9 3 4 5 5
6 7 8 9 7
3 6 8 9 1
3 4 2 1 4
6 4 4 7 7

$ python
Python 2.7.3 (default, Jun 19 2012, 17:11:17) 
[GCC 4.4.3] on hp-ux11
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>>
>>> f = open('./matrix.txt')
>>> for row in zip(*[sorted(list(a)) 
               for a in zip(*[a.split() for a in f.readlines()])]):
...    print ' '.join(row)
... 
1 1 1 1 1
3 3 2 1 1
3 4 4 5 4
6 4 4 7 5
6 6 8 9 7
9 7 8 9 7

试着在
排序
手册页中查找，或者在谷歌中搜索，并查看100个相关结果中的一个。我在谷歌中搜索过，你所说的100个相关帖子实际上对我的情况没有帮助。我已经被困在我的代码的这一部分大约2天了，我在谷歌上找到的东西没有任何帮助。我不知道每个文件中将包含多少列，所以我不确定如何使用-k选项对未知数量的列进行排序。我也试过wc-w和-l之类的东西，但也没有帮到我。对不起，你到底想做什么，你能发布预期的输出吗？如果我读对了，他想独立地阅读/排序/显示每一列。我能想到的方法只有两种：（1）将每一列读入一个单独的数组并进行排序，或者（2）按顺序读取/排序每一列，从每个连续排序中删除第一列。在bash中，两者都不会看起来完全漂亮。嵌套的awk也可以工作。将其发布在问题中。OP在评论中说，列数未知。
我不知道每个文件中的列数。
忽略了这一点，这是我说它不漂亮的另一个原因。问题陈述中的哪一列是未知数？我会给未知栏目一个重做的机会。它只是在评论中说出来，而不是真正的问题。没关系，我在评论中找到了它。它需要将所有值读取到一个矩阵中，并根据第一行中读取的值的数量设置一个
步长。我们明天早上再看。我的帽子要挂在
awk
解决方案上了。有一件事你可以帮我。你能简单解释一下这些循环的嵌套方式吗？特别是
d
名称是如何填写/初始化的？很好的解决方案，我正在尝试消化它。@DavidC.Rankin
for（I=1；I
#!/bin/bash

test -z "$1" && {           ## validate number of input
    printf "insufficient input. usage:  %s <filename>\n" "${0//*\//}"
    exit 1;
}

test -r "$1" || {           ## validate file was readable
    printf "error: file not readable '%s'. usage:  %s <filename>\n" "$1" "${0//*\//}"
    exit 1;
}

## function: my sort integer array - accepts array and returns sorted array
## Usage: array=( "$(msia ${array[@]})" )
msia() {
    local a=( "$@" )
    local sz=${#a[@]}
    local _tmp
    [[ $sz -lt 2 ]] && { echo "Warning: array not passed to fxn 'msia'"; return 1; }
    for((i=0;i<$sz;i++)); do
        for((j=$((sz-1));j>i;j--)); do
        [[ ${a[$i]} -gt ${a[$j]} ]] && {
            _tmp=${a[$i]}
            a[$i]=${a[$j]}
            a[$j]=$_tmp
        }
        done
    done
    echo ${a[@]}
    unset _tmp
    unset sz
    return 0
}

declare -a a1               ## declare arrays and matrix variables
declare -a a2
declare -i cnt=0
declare -i stride=0
declare -i sz=0

while read line; do         ## read all lines into array
    a1+=( $line );
    (( cnt == 0 )) && stride=${#a1[@]}  ## calculate matrix stride
    (( cnt++ ))
done < "$1"

sz=${#a1[@]}                ## calculate matrix size
                            ## print original array
printf "\noriginal array:\n\n"
for ((i = 0; i < sz; i += stride)); do
    for ((j = 0; j < stride; j++)); do
        printf " %s" ${a1[i+j]}
    done
    printf "\n"
done

                            ## sort columns from stride array
for ((j = 0; j < stride; j++)); do
    for ((i = 0; i < sz; i += stride)); do
        arow+=( ${a1[i+j]} )
    done
    a2+=( $(msia ${arow[@]}) )  ## create sorted array
    unset arow
done
                            ## print the sorted array
printf "\nsorted array:\n\n"
for ((j = 0; j < cnt; j++)); do
    for ((i = 0; i < sz; i += cnt)); do
        printf " %s" ${a2[i+j]}
    done
    printf "\n"
done

exit 0

$ bash sort_cols2.sh dat/matrix.txt

original array:

 1 1 1 1 1
 9 3 4 5 5
 6 7 8 9 7
 3 6 8 9 1
 3 4 2 1 4
 6 4 4 7 7

sorted array:

 1 1 1 1 1
 3 3 2 1 1
 3 4 4 5 4
 6 4 4 7 5
 6 6 8 9 7
 9 7 8 9 7

#!/bin/bash

linenumber=0
while read line; do
        i=0
        # Create an array for each column.
        for number in $line; do
                [ $linenumber == 0 ] && eval "array$i=()"
                eval "array$i+=($number)"
                (( i++ ))
        done    
        (( linenumber++ ))
done <$1
IFS=$'\n'
# Sort each column
for j in $(seq 0 $i ); do
        thisarray=array$j
        eval array$j='($(sort <<<"${'$thisarray'[*]}"))'
done    
# Print each array's 0'th entry, then 1, then 2, etc...
for k in $(seq 0 ${#array0[@]}); do
        for j in $(seq 0 $i ); do
                eval 'printf ${array'$j'['$k']}" "'
        done    
        echo "" 
done

$ cat matrix.txt 
1 1 1 1 1
9 3 4 5 5
6 7 8 9 7
3 6 8 9 1
3 4 2 1 4
6 4 4 7 7

$ python
Python 2.7.3 (default, Jun 19 2012, 17:11:17) 
[GCC 4.4.3] on hp-ux11
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
>>>
>>> f = open('./matrix.txt')
>>> for row in zip(*[sorted(list(a)) 
               for a in zip(*[a.split() for a in f.readlines()])]):
...    print ' '.join(row)
... 
1 1 1 1 1
3 3 2 1 1
3 4 4 5 4
6 4 4 7 5
6 6 8 9 7
9 7 8 9 7