我如何在bash ubuntu中更改一个包含csv名称列表的txt文件的代码？

我有一个txt文件，其中有几个代码及其元数据。然而，我一直在研究如何用名称更改这些代码

为此，我有一个csv列表，有两列，其中一列是代码，另一列是名称。这些是79

这是我写的剧本草稿：

#这里，变量“Nombre”是Nombre_codigos.csv文件第1列的值，变量“Codigo”是Nombre_codigos.csv文件第2列的值
#
#然后，我使用命令sed将“Codigo”的值替换为“Nombre”的值，以读取RAxML_bipartitions_newick.newick文件
#!/bin/bash
阅读nombres_codigos.csv
读取时-r行| |[-n$line]]
做
Nombre=“${line%；*}”
Codigo=“${line#*}”
回声“$Nombre”
echo“$Codigo”
阅读RAxML\u bipartitions\u newick.newick
读取时-r行| |[-n“$line”]
做
如果[“$Nombre”==“$Codigo”]
然后
sed-i“s/$Nombre/$Codigo/g”RAxML\u bipartitions\u newick.newick
回声“再采样”
其他的
回声“无再采样”
fi
完成

p、 s:nombres_codigos.csv类似于：

名义上；Codigo
EU528205_Floripondio_A56y7；EU528205_F
FJ710459_Floripondio_ABCD；FJ710459_F
EF514777_Floripondio123；EF514777_F
EU528999_Floripondio1；EU528999_F

nombres.sh：第2行：读取：`nombres_codigos.csv'：不是有效的标识符
nombres.sh:第21行：语法错误：文件意外结束

But I hope from the file RAxML_bipartitions_newick.newick:

(()()()(EU528205:100005000176948E-6,FJ710459):100005000176948E-6):100005000176948E-6,EF514777)100005000176948E-6)

switch to this:

Could someone help me modifying this, please? Thanks very much.

（（）

switch to this:

Could someone help me modifying this, please? Thanks very much.

---

我不是100%确定您想要完成什么，但是您似乎想从

nombres_codigos.csv

中读取每一行，然后在分号上拆分该行。然后您想检查这两个部分是否相同（这对于接下来的

sed

表达式没有意义）

一个直接的，尽管经过清理的重新格式化将是：

#!/bin/bash

while read -r line || [ -n "$line" ]
do
  Nombre="${line%;*}"   ## separate using bash built-in parameter expansions
  Codigo="${line#*;}"
  
  echo "$Nombre"
  echo "$Codigo"
  
  if [ "$Nombre" == "$Codigo" ]
  then
    sed -i "s/$Nombre/$Codigo/g" RAxML_bipartitions_newick.newick
    echo "reemplazar"
  else            
    echo "no reemplazar"
  fi
done < nombres_codigos.csv

---

这将使脚本看起来的功能保持一致（例如，使用文件

RAxML\u bipartitions\u newick.newick

中的

“$Codigo”

更改

“$Nombre”

的所有实例）如果是这样的话，那就改变条件，让我知道你还有什么问题。

你面对的是什么？你想通过修改来实现什么？你想把你的代码粘贴到帮助语法错误的地方。e来自

nombres_codigos.csv的数据样本，脚本生成的（错误）输出，以及cat中i的（正确）所需输出是危险的uuooc（*不必要地使用
cat
），相反，如果要使用循环，则在读取第| |[-n“$line]”行时是
；do…done
（
|124;[-n“$line”]
部分保护那些无法将
'\n'
作为最终字符的文件）我找到了示例行…是的，就是这样--“在文件RAxML_bipartitions_newick.newick中用“$code”更改“$Name”的所有实例”---是我想要做的。只有名称和代码值在一个名为codes_names.csv的csv文件中。我刚刚编辑了这篇文章。上面的更改应该可以让你接近。你可以用
替换
<“$1”
并将
.csv
文件的名称作为参数传递给脚本。我没有要测试的
RAxML\u bipartitions\u newick.newick
文件，但我创建了一个简单的文本文件，其中包含
$Nombre
值的行，运行脚本会用相应的
$Codigo替换它们de>值。