MPI-MPI_Recv中的消息截断

我在一个与MPI开发相关的项目中遇到了问题。我正在使用MPI实现一个RNA解析算法，在该算法中，我根据一些解析规则和主节点的解析表（包含不同的状态和相关操作）开始解析输入字符串。在解析表中，每个状态都有多个操作，可以并行执行。因此，我必须在不同的过程中分配这些操作。为此，我使用单独的线程将当前状态和解析信息（当前解析堆栈）发送到节点，以接收来自其他节点的操作，而主线程正忙于基于接收到的操作进行解析。以下是发送方和接收方的代码片段：

发件人代码：

StackFlush(&snd_stack);
StackPush(&snd_stack, state_index);
StackPush(&snd_stack, current_ch);
StackPush(&snd_stack, actions_to_skip);
elements_in_stack = stack.top + 1;
for(int a=elements_in_stack-1;a>=0;a--)
                StackPush(&snd_stack, stack.contents[a]);
StackPush(&snd_stack, elements_in_stack);
elements_in_stack = parse_tree.top + 1;
for(int a=elements_in_stack-1;a>=0;a--)
                StackPush(&snd_stack, parse_tree.contents[a]);
StackPush(&snd_stack, elements_in_stack);
elements_in_stack = snd_stack.top+1;
MPI_Send(&elements_in_stack, 1, MPI_INT, (myrank + actions_to_skip) % mysize, MSG_ACTION_STACK_COUNT, MPI_COMM_WORLD);
MPI_Send(&snd_stack.contents[0], elements_in_stack, MPI_CHAR, (myrank + actions_to_skip) % mysize, MSG_ACTION_STACK, MPI_COMM_WORLD);

接收器代码：

MPI_Recv(&e_count, 1, MPI_INT, MPI_ANY_SOURCE, MSG_ACTION_STACK_COUNT, MPI_COMM_WORLD, &status);
if(e_count == 0){
                break;
}
while((bt_stack.top + e_count) >= bt_stack.maxSize - 1){usleep(500);}
pthread_mutex_lock(&mutex_bt_stack); //using mutex for accessing shared data among threads
MPI_Recv(&bt_stack.contents[bt_stack.top + 1], e_count, MPI_CHAR, status.MPI_SOURCE, MSG_ACTION_STACK, MPI_COMM_WORLD, &status);
bt_stack.top += e_count;
pthread_mutex_unlock(&mutex_bt_stack);

对于通信量较少的小输入，程序运行良好，但随着我们增加输入大小，相应地增加了通信量，因此接收器在处理少量请求的同时接收到许多请求，然后程序崩溃，出现以下错误：

MPI_Recv中出现致命错误：消息被截断，错误堆栈： MPI_Recv（186）……：MPI_Recv（buf=0x5b8d7b1，计数=19，MPI_字符，src=3，标记=1，MPI_通信世界，状态=0x41732100）失败 MPIDI_CH3U_请求_解包_uebuf（625）L消息被截断；接收到21字节，但缓冲区大小为19 作业73 hpc081_56549中的等级0导致所有等级的集体中止等级0的退出状态：被信号9杀死

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我也尝试过使用非阻塞MPI调用，但仍然出现类似的错误。

我不知道其余代码是什么样子，但这里有一个想法。由于存在一个

中断

，我假设接收方代码是循环或switch语句的一部分。如果是这种情况，则当元素计数变为0时，发送和接收之间存在不匹配：

发送方将发送元素计数和长度为零的消息（MPI_发送（&snd_stack.contents…行）

第二条消息将没有匹配的receive，因为接收方中断了循环

然后，长度为零的消息将与其他消息匹配，这可能会导致您看到的错误

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该错误表示

MPI_Recv

接收的数据比预期的多（21个字符而不是19个字符）。是否有多个线程运行接收器代码？如果是，则可能是有一个线程接收另一个线程的数据，因此

e_计数不同。