C++ 使用CMake时由于HDF5兼容性问题导致的链接错误

快速提问：如何编写CMakeLists.txt以避免下面描述的HDF5链接问题

我用HDF5库（1.101）制作C++项目，
我通过源代码文件tarball和CMake安装了它。
（安装在

/usr/local/

）
我还使用CMake为我的项目配置生成环境。
（CentOS 7上的CMake 3.8.1、g++5.3.1）

最近，由于链接错误，我的应用程序无法编译。
（附在下面的错误日志）
发现HDF5 1.8.12也是在我的一位同事更新服务器和一些软件包的过程中安装的。
这些库文件位于

/usr/lib64/

中
因此，我认为，

• 包含文件引用自1.10.1
• 链接时参考1.8.12中的库
• 兼容性问题（即，这些API在HDF5.1.12中没有定义），导致链接错误
  （我查了HDF5C++ API引用，它看起来是真的）

因此，我应该如何编写/修复CMakeLists.txt以避免此类链接错误？
i、 e.在这种情况下，如何正确链接HDF5 1.10.1？

编辑：添加了更多关于CMakeLists.txt的详细信息
以下是关于我的项目的CMakeLists.txt的一些详细信息：

cmake_minimum_required(VERSION 3.8.1)

# Reference: https://github.com/dmonopoly/gtest-cmake-example/blob/master/CMakeLists.txt

project (adl-boilerplate)

enable_language(CXX)

set(CMAKE_CXX_STANDARD 14)
set(CMAKE_CXX_STANDARD_REQUIRED ON)
set(CMAKE_CXX_EXTENSIONS OFF)

set(Boost_USE_STATIC_LIBS OFF)
set(Boost_USE_MULTITHREADED ON)
set(Boost_USE_STATIC_RUNTIME OFF)
find_package(Boost 1.64.0 COMPONENTS program_options)

option(ENABLE_HDF5 "Enable HDF5 support" ON)
if(ENABLE_HDF5)
    set(HDF5_ROOT /usr/local/hdf5/)
    find_package(HDF5 "1.10.1" REQUIRED)
    if(HDF5_FOUND)
        include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIR})
        set(_hdf5_libs hdf5 hdf5_cpp hdf5_hl hdf5_hl_cpp)
        message(STATUS "HDF5 root: ${HDF5_ROOT}")
        message(STATUS "HDF5 version: ${HDF5_VERSION}")
        message(STATUS "HDF5 include dir: ${HDF5_INCLUDE_DIRS}")
        message(STATUS "HDF5 CXX lib: ${HDF5_LIBRARIES}")
        message(STATUS "CMake library path: " ${CMAKE_LIBRARY_PATH})
    else()
        # Download HDF5 library and define hdf5_local
        # ...
    endif()
endif()

# Get includes/srcs
file(GLOB_RECURSE adl-boilerplate_SOURCES "src/*.cpp")
file(GLOB_RECURSE adl-boilerplate_HEADERS "src/*.h")

set(adl-boilerplate_INCLUDE_DIRS "include")
include_directories(${adl-boilerplate_INCLUDE_DIRS})

if(ENABLE_HDF5)
    add_executable(
    runner
    ${adl-boilerplate_SOURCES}
    )
    target_link_libraries(
        runner
        ${_hdf5_libs}
        )
endif()

if(Boost_FOUND)
    include_directories(${Boost_INCLUDE_DIRS})
    target_link_libraries(runner ${Boost_LIBRARIES})
endif()

下面是我执行

make

[100%] Linking CXX executable runner
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o: In function 
'CGociHdf5Handler::OpenRrs(CGociHdf5Handler::AvailableRrs)':
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x166b): undefined reference to 
`H5::H5Location::openDataSet(std::string const&) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x18ad): undefined reference to 
`H5::H5Object::attrExists(std::string const&) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x18e1): undefined reference to 
`H5::H5Object::openAttribute(std::string const&) const'
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o: In function 
`CGociHdf5Handler::OpenFlags()':
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x1c72): undefined reference to 
`H5::H5Location::openDataSet(std::string const&) const'
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o: In function 
`CGociHdf5Handler::WriteOutput(std::unique_ptr<float [], 
std::default_delete<float []> >, std::string)':
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x20af): undefined reference to 
`H5::H5Location::createGroup(char const*, unsigned long) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x20cc): undefined reference to 
`H5::H5Location::createGroup(char const*, unsigned long) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x20e9): undefined reference to 
`H5::H5Location::createGroup(char const*, unsigned long) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x2109): undefined reference to 
`H5::H5Location::createGroup(char const*, unsigned long) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x2179): undefined reference to 
`H5::H5Location::createDataSet(std::string const&, H5::DataType const&, 
H5::DataSpace const&, H5::DSetCreatPropList const&) const'
GociHdf5Handler.cpp:(.text+0x2229): undefined reference to 
`H5::H5Object::createAttribute(std::string const&, H5::DataType const&, 
H5::DataSpace const&, H5::PropList const&) const'
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[2]: *** [runner] 오류 1
make[1]: *** [CMakeFiles/runner.dir/all] 오류 2
make: *** [all] 오류 2

[100%]链接CXX可执行运行程序
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o:函数中
“CGociHdf5Handler:：OpenRrs（CGociHdf5Handler:：availableerrs）”：
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x166b）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：openDataSet（std:：string const&）const'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x18ad）：对的未定义引用
`H5:：H5对象：：属性存在（std:：string const&）const'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x18e1）：对的未定义引用
`H5:：H5Object:：openAttribute（std:：string const&）const'
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o:函数中
`CGociHdf5Handler:：OpenFlags（）'：
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x1c72）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：openDataSet（std:：string const&）const'
CMakeFiles/runner.dir/src/GociHdf5Handler.cpp.o:函数中
`CGociHdf5Handler:：WriteOutput（std:：unique_ptr，std:：string）“”：
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x20af）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：createGroup（字符常量*，无符号长）常量'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x20cc）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：createGroup（字符常量*，无符号长）常量'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x20e9）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：createGroup（字符常量*，无符号长）常量'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x2109）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：createGroup（字符常量*，无符号长）常量'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x2179）：对的未定义引用
`H5:：H5Location:：createDataSet（标准：：字符串常量&，H5:：数据类型常量&，
H5:：数据空间常数&，H5:：DSetCreatPropList常数&）常数'
GociHdf5Handler.cpp:（.text+0x2229）：对的未定义引用
`H5:：H5Object:：createAttribute（std:：string const&，H5:：DataType const&，
H5:：数据空间常数&，H5:：PropList常数&）常数'
collect2:错误：ld返回了1个退出状态
make[2]：***[runner]오류 1.
make[1]：***[CMakeFiles/runner.dir/all]오류 2.
制作：**[全部]오류 2.

使用

find_-package

意味着您的代码将在

包含目录和
目标链接库中使用它在中定义的变量

根据，您的案例的正确用法为：

# Explicitely list required HDF5 components
find_package(HDF5 COMPONENTS CXX HL)

include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIRS})
target_link_libraries(
    runner
    ${HDF5_LIBRARIES} # This should list all libraries.
)

HDF5的cmake“finder”可能受环境变量
HDF5\u ROOT
的影响，以确定在多个安装的情况下要使用的HDF5安装

创建新的生成目录以删除任何缓存设置

定义
HDF5\u根

export HDF5_ROOT=/usr/local


（如果HDF5位于子目录中，则导出HDF5_ROOT=/usr/local/HDF5-1.10.1
）

再次运行cmake
创建新版本或删除缓存设置非常重要，否则将无法获取该设置

如果这不起作用，我建议删除HDF的
/usr
安装。
我仍然没有消除错误：-（就在
target\u link\u libraries
之前，我添加了
消息（状态为“HDF5\u libraries:${HDF5\u libraries}”）
在
$HDF5_库的位置上没有显示任何内容。我应该调查什么？我添加了当前CmakeList的更多详细信息。TXT奇怪的是，变量HDF5_库就是其中之一。CMake应该将变量的空性视为“未找到包”。顺便问一句，您确定
查找_包（HDF5）吗
是否实际找到了软件包？在配置过程中，它应该反映在CMake消息中。