什么是';集装箱';在Cytoscape中合并多个网络时创建节点?

什么是';集装箱';在Cytoscape中合并多个网络时创建节点?,cytoscape,Cytoscape,我使用Cytoscape合并了从KEGG获得的190个网络。合并网络有一个名为“容器”的节点,该节点与其他几个节点高度连接。节点“容器”不是来自原始路径文件。这个节点代表什么?它的意义是什么? 我很确定这也不是来自Cytoscape的合并工具。我最好的猜测是,你的一些路径有“容器”节点,包裹着一个复杂的或一组基因。在合并过程中,这些节点都将成为同一个节点。即使在网络视图中看不到“容器”节点,也要检查它是否出现在节点表的任何位置 --scooter非常感谢您的回复。我更深入地研究了这一点,你是对的

我使用Cytoscape合并了从KEGG获得的190个网络。合并网络有一个名为“容器”的节点,该节点与其他几个节点高度连接。节点“容器”不是来自原始路径文件。这个节点代表什么?它的意义是什么?

我很确定这也不是来自Cytoscape的合并工具。我最好的猜测是,你的一些路径有“容器”节点,包裹着一个复杂的或一组基因。在合并过程中,这些节点都将成为同一个节点。即使在网络视图中看不到“容器”节点,也要检查它是否出现在节点表的任何位置


--scooter

非常感谢您的回复。我更深入地研究了这一点,你是对的。一些蛋白质被分组在一个“容器”中,在合并它们时,不同的“组节点”被认为是一个。