Graph 如何在3D中可视化图形/网络

我正在使用网络，这些网络的顶点是具有特定坐标的大脑区域的节点

我需要在3D环境中可视化这些网络，以便更好地理解我的结果

到目前为止，我已经尝试使用R中的igraph库的

rglplot

来绘制它们，但结果实际上并不太好。 目前，我正在使用每对轴（XY、XZ、YZ）上的投影绘制它们

此外，我还尝试了一些工具，如

gephi

，但似乎3D并不真正受支持

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有一些工具或软件可以在3D空间中可视化网络？

事实证明，Gephi支持图形的3D显示，只需按住鼠标滚轮，在概览窗格中平移图形即可看到效果！此外，旋转选项仅限于在x轴上旋转

有关使用Force Atlas 3d算法绘制的图，请参见下面的示例

您还可以借助

datalaboratoryhelper

插件在数据实验室内设置坐标。请参见下面的屏幕截图

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您所说的“在每对轴（XY、XZ、YZ）上使用投影”是什么意思。无论如何，我知道我能做到，而且我的意思是，我在每一对维度上用2d绘制。谢谢你对这些工具的建议。我记得它是如何为Gephi工作的，请参见下面的我的答案。你能使用你的顶点坐标集来可视化图形吗？因为我不知道怎么做。是的，我知道！实际上，您可以使用“Data Laboratory helper”插件，它将允许您将其中一列重新设置为x、y、z坐标，请参见此处的讨论：似乎您只能设置x和y，而我还必须设置z。实际上，也可以通过选择

set standard column

，来设置z坐标，请参见编辑文章中的屏幕截图