无法在Ubuntu13.04的R3.0中安装rJava

我无法在

R3.0

中调用

rJava

软件包。我得到了以下信息

Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it

我尝试重新安装

rJava

软件包时出错。我已经提供了

R CMD javareconf

Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.7.0_21
Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre
Java compiler    : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags    : 
detected JNI linker flags : 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O2 -pipe -g  -c conftest.c -o conftest.o
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program


Java library path: 
JNI cpp flags    : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.

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我正在使用Ubuntu 13.04。我还尝试了

apt get install r-cran-rjava

，但这无助于解决问题。关于jni.h，有一些解决方案，但不确定如何使用这里的解决方案

我遇到了完全相同的问题。我的解决方案是通过

sudo apt-get install openjdk-7-*

紧随其后的是

sudo R CMD javareconf

然后我可以通过

install.packages（“rJava”）

在R中安装rJava

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虽然可能不是最优雅的解决方案，但它似乎解决了我让rJava工作的问题。

对于那些遇到错误的人：

error: unable to load shared object '/some/dir/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so: 
cannot open shared object file: No such file or directory

我解决了在系统中定位库并将它们链接到

/usr/lib

的错误：

$sudo updatedb
$locate libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
$sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib/ 

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从配电包中安装rJava的建议也适用于：

sudo apt-get install r-cran-rjava

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注意：在Debian系统上尝试过。

我也遇到了与RHEL8.1相同的错误&我解决了它，如下所示：

yum --enablerepo=* install java-1.8* 

后来我运行了相同的命令，该命令给出了R服务器的错误日志

R CMD javareconf

转换为以下输出

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谢谢。成功了。我昨天试过安装java。我也试过Oracle java，但没有成功。我不确定我是安装JRE还是重新启动成功了。我运气不好：前两步运行时没有错误，然后在

install.packages

上，我得到：

错误：无法加载共享对象'/home/cboettig/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/rJava/libs/rJava.so'：

libjvm.so:无法打开共享对象文件：没有这样的文件或目录。有什么想法吗？我遇到了同样的问题——没有成功。最后发现，在安装Java 1.7之后，我不得不告诉Ubuntu将其作为默认值使用-请参阅-使用

更新Java替代品-l

获取已安装的Java版本列表，并将

sudo更新Java替代品-s Java-1.7.0-openjdk-i386

默认为1.7。在此之后，

sudo R CMD javareconf

运行无误，我能够

安装.packages（“rJava”）

对于最近看到这个的人，请尝试

sudo apt get install openjdk-8-*

在Ubuntu 18.04上运行（例如安装R packages

xlsx

或

ELT

）